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公司办理医疗器械许可证需要身份证和毕业证信息，一般来说对员工没有影响。医疗器械公司需要提供的资料包括企业资质、产品资质、储存条件等。注册医疗器械公司需要涉及医药、机械、电子等多个行业知识。对于借出身份证和毕业证注册医疗器械公司的行为，存在一定风险，应谨慎对待。如果不是公司法人，风险相对较小，但仍需注意保护个人信息，避免被用于不当用途。一旦公司发生问题，可能需要承担相应的法律责任。因此，建议不将身份证和毕业证原件借出，可以提供给公司复印件，但要在使用完毕后及时收回。医疗器械公司的注册资料填写应在合法合规的范围内进行，确保个人信息的合法使用。