1956年，安徽交通学校正式创立。
到了1958年，学校升级为安徽交通学院。
1961年，安徽交通学院（中专部）与安徽中等专业技术学校合并，共同组成了新的安徽交通学校。
同年，原安徽交通学院宣布撤销。
1961年，安徽交通学院的部分资产及资源并入安徽工学院。
1970年，安徽交通学校再次撤销。
1973年，安徽交通学校得以恢复办学。
1988年，安徽大学交通分校及安徽交通干部学校相继成立。
2001年6月，安徽大学交通分校与安徽交通学校合并，并与安徽交通干部学校共同办公，最终形成了安徽交通职业技术学院。
2006年，学院通过了教育部的人才培养水平评估，被评为优秀院校。
2008年，学院被选为安徽省首批省级示范院校。
2010年，学院获得批准，成为“国家示范性高等职业院校建设计划”骨干高职院校立项建设单位。
以下是学院系部设置与专业分类：
- 专科 道路桥梁工程技术（工科类）
- 专科 市政工程技术（工科类）
- 专科 土木工程检测技术（工科类）
- 专科 铁道工程技术（工科类）
- 专科 港口工程技术（工科类）
- 专科 工程造价（工科类）
- 专科 公路监理（工科类）
- 专科 地下工程与隧道工程技术（工科类）
- 专科 建筑工程技术（工科类）
- 专科 高等级公路维护与管理（工科类）
- 专科 安全技术管理等专业（工科类）
- 专科 汽车运用与维修（工科类）
- 专科 汽车制造与装配技术（工科类）
- 专科 汽车电子技术（工科类）
- 专科 汽车技术服务与营销（工科类）
- 专科 汽车整形技术（工科类）
- 专科 保险实务（工科类）
- 专科 工程机械运用与维护（工科类）
- 专科 机电一体化技术（工科类）
城市轨道交通与信息工程系：
- 专科 计算机多媒体技术（工科类）
- 专科 动漫设计与制作（工科类）
- 专科 计算机应用技术专业（工科类）
- 专科 计算机网络技术（工科类）
- 专科 城市轨道交通控制（工科类）
- 专科 城市轨道交通运营管理（工科类）
- 专科 交通安全与智能控制（工科类）
- 专科 城市轨道交通车辆（工科类）
- 专科 物流管理（管理学类）
- 专科 电子商务（管理学类）
- 专科 旅游管理（管理学类）
水运工程系：
- 专科 航海技术（工科类）
- 专科 轮机工程技术（工科类）
- 专科 商务英语（文学类）
- 专科 城市交通运输（工科类）
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