1950年3月，随着中国共产党接管国民党财政厅，为满足当时对大量财政会计管理人才的需求，设立了财政干部训练班，培养了将近400名干部。
1951年初，云南省财政与干部学校将财政干部训练班转型升级为云南省财政干部学校，并正式启用印章。同年6月，财政厅决定由副厅长翟昌宗同志兼任财政干部学校校长。此后，云南省陆续成立了商业干部学校、粮食干部学校、供销干部学校、银行干部学校，与财政干部学校一同构成了五所干部学校（简称“小干校”）。
到了1958年底，中共云南省委同意将财贸系统的五所干部学校合并，成立了云南省财贸干部学校（简称“大干校”）。
1964年3月，中共云南省委决定撤销云南省财贸干部学校，恢复建立商业、合作、财政、银行四个专业干校，并指定四所干校分别由省商业厅、供销社、财政厅和人民银行云南省分行主管。
在“文化大革命”期间，这些干校遭受了严重破坏，校舍被占用，教师全体下放到“五七”干校劳动。经过相关业务部门的努力，1973年6月，粮食干校、商业干校和财政金融干校得以恢复。
1978年6月19日，中共云南省委决定将上述三所干校再次合并，成立云南省财贸干部学校，定位为局一级单位，由省委财贸政治部领导。
1979年3月30日，云南省革命委员会批准财贸干部学校开设财贸大专班，招收大专生（79级学制为两年，80、81级学制为三年），实际上是为创办本科院校做准备。
1981年8月26日，国务院教育部发布《关于增设云南财贸学院的通知》，同意成立云南财贸学院，作为本科高等学院，由云南省领导。同年11月7日，省政府会议决定，财贸学院的日常工作由省教委和省委财贸办公室（简称“财办”）共同管理，以“财办”为主。
云南经济管理干部学院的前身是成立于1979年11月的云南省工业干部学校。
1983年8月，云南省政府决定将该校更名为“云南经济管理干部学院”。
1998年2月，云南省政府决定并与教育部批准，将云南经济管理干部学院与云南财贸学院合并，成立新的云南财贸学院。
1999年2月，新的云南财贸学院正式成立。
2006年2月，教育部正式批准云南财贸学院更名为云南财经大学。
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