1959年3月，伴随着我国核武器和核工业的发展需求，原中南矿冶学院矿冶工程系等专业系迁至衡阳，成立了衡阳矿冶工程学院。
1961年5月，中央军委副总参谋长张爱萍、二机部部长刘杰亲临衡阳矿冶工程学院进行视察。
1969年11月，由于"文革"的影响，衡阳矿冶工程学院暂停办学。
1979年11月，衡阳矿冶工程学院恢复办学。
1983年1月，学校更名为衡阳工学院，由核工业部和湖南省共同领导，以核工业部为主导。国务院副总理、中央军委副秘书长张爱萍亲自题写了"衡阳工学院"的校名。
1988年7月，机械制造工艺及设备、工业与民用建筑、财务会计、计算机软件和核电子学与核技术应用等五个本科专业获得了学士学位授予权。
1993年6月，衡阳工学院更名为中南工学院，国务院副总理张爱萍再次题写了校名。
1998年6月，国务院学位委员会批准中南工学院成为硕士学位授权单位。与此同时，衡阳医学院的发展历程如下：
1956年6月，经国务院批准，开始筹建衡阳医学院，省委宣传部部长唐麟担任筹委会主任，湖南省文教办主任华国锋担任筹委会副主任。
1958年6月，衡阳医学院正式成立，并开始招收公共卫生专业3年制专科生。
1959年6月，开始招收医疗专业5年制本科生。
1962年秋季，衡阳医学院停办，改为衡阳医学高等专科学校。
1977年7月，恢复衡阳医学院建制，开始招收医疗和五官科学专业5年制本科生。
1981年12月，国务院学位委员会批准衡阳医学院为全国首批拥有学士学位授予权的高等院校。
1986年，国务院学位委员会批准衡阳医学院为硕士学位授权单位，获得了病理学与病理生理学、药理学、病原生物学、肿瘤学、外科学五个硕士点。
1962年6月，为满足铀矿山地质研究、采矿研究、化学分析以及放射性仪器研制的需求，中共二机部党组与江西省委在江西矿务局研究所的基础上组建了"南昌矿业研究所"，简称南昌所。
1966年，第二机械工业部第一设计院的矿山设计部分与南昌所合并，成立了二机部第三研究设计院，简称三院。
1969年，三院与二机部第一研究设计院的水冶设计部分合并，成立了二机部第四设计研究院，简称四院，并由南昌迁至衡阳。
1975年，在四院科研室的基础上组建了湖南矿山研究所，代号为湖南六所，也称湖南铀矿开采研究所。
1978年4月，5项科研成果荣获1978年全国科学大会奖。
1982年，更名为核工业部铀矿开采研究所。
1983年，更名为核工业部第六研究所。
1988年，更名为核工业第六研究所。
1999年，国务院副总理张爱萍为核工业第六研究所题写了所名。以下是南华大学的发展历程：
2000年3月27日，经教育部批准，中南工学院与衡阳医学院合并，组建了南华大学。
2002年10月11日，核工业第六研究所、核工业四一五医院并入南华大学。
2001年9月8日，全国人大常委会副委员长周光召为南华大学题词："科教兴国，南华争先。"
2002年2月6日，国防科学技术工业委员会与湖南省政府正式签署协议，共建南华大学。
2003年9月，国务院学位委员会批准南华大学为博士学位授权单位，核技术及应用、病理学与病理生理学两个学科获得博士学位授予权。
2003年11月8日，中共中央政治局常委周永康视察南华大学附一医院。
2005年10月1日，全国人大副委员长韩启德院士题写了"南华园"石碑。
2006年12月21日，国防科学技术工业委员会与湖南省人民政府在北京签署了"十一五"共建南华大学协议，南华大学国防科学技术学院正式授牌。
2007年9月，国家人事部和全国博士后管委会批准设立了核科学与技术一级学科博士后科研流动站。
2013年12月6日，湖南省人民政府与中国核工业建设集团在北京举行了共建南华大学协议签字仪式。
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