玉溪师范学院自1978年创立之初，原名为玉溪师范高等专科学校，奠定了一所注重师范教育的综合性大学基础。
在1992年更名为玉溪师范高等专科学校，并于2000年3月经教育部批准，与原玉溪师范学校、玉溪成人教育培训中心合并，共同组成了今天的玉溪师范学院。合并后，原玉溪师范学校校区转型为玉溪师院附中，成为学院相对独立的一部分。玉溪师范学院由此融合了原玉溪师范高等专科学校及玉溪成人教育培训中心的教育资源。
2007年，学校成功通过了教育部的本科教学工作水平评估。
以下是玉溪师范学院的学院及专业设置：
- 教育学院：小学教育、学前教育
- 理学院：数学与应用数学、信息与计算科学
- 商学院：国际经济与贸易、信息管理与信息系统、工商管理、市场营销
- 外国语学院：英语、泰语、泰语（商务）、泰语（旅游）
- 音乐学院：音乐学、舞蹈学、舞蹈教育
- 政法学院：法学、社会工作、思想政治教育
- 资源环境学院：地理科学、自然地理与资源环境、人文地理与城乡规划、生物科学、环境科学、农业资源与环境、应用化学、化学
- 艺术学院：数字媒体艺术、环境设计、视觉传达设计、绘画
- 文学院：汉语言文学、汉语国际教育、新闻学
- 信息技术工程学院：电气工程及其自动化、通信工程、计算机科学与技术、自动化
- 体育学院：体育教育、社会体育指导与管理
此外，玉溪师范学院还设有成人教育学院和（高等职业技术学院），提供食品药品监督管理、会计电算化等专业课程。
国际文化学院则开设了泰语（旅游方向）和泰语（商务方向）等专业方向。
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