1950年3月，随着中国共产党接管国民党财政厅，为满足当时对大量财政会计管理人才的需求，创立了财政干部训练班，培养了将近400名干部。
1951年初，云南省财政与干部学校的前身——财政干部训练班转型升级为云南省财政干部学校，并正式启用印章。同年6月，财政厅决定由副厅长翟昌宗同志兼任财政干部学校校长。此后，云南省商业干部学校、粮食干部学校、供销干部学校、银行干部学校相继成立，形成了五所干部学校（俗称“小干校”）。
到了1958年底，中共云南省委同意将财贸系统的五所干部学校合并，成立了云南省财贸干部学校（俗称“大干校”）。
1964年3月，中共云南省委决定撤销云南省财贸干部学校，恢复建立商业、合作、财政、银行四个专业干校，并指定四所干校分别由省商业厅、供销社、财政厅和人民银行云南省分行主管。
在“文化大革命”期间，这些干校遭受严重破坏，校舍被占用，教师全体下放到“五七”干校劳动。经过相关部门的努力，1973年6月，粮食干校、商业干校和财政金融干校得以恢复。
1978年6月19日，中共云南省委决定将上述三所干校再次合并，成立云南省财贸干部学校，作为局一级单位，由省委财贸政治部领导。
1979年3月30日，云南省革命委员会批准财贸干部学校开设财贸大专班，招收大专生（79级学制为两年，80、81级学制为三年），实际上是为创办本科院校做准备。
1981年8月26日，国务院教育部发布《关于增设云南财贸学院的通知》，同意成立云南财贸学院，作为本科高等学院，由云南省领导。同年11月7日，省政府会议决定，财贸学院的日常工作由省教委和省委财贸办公室（简称“财办”）管理，以“财办”为主。
云南经济管理干部学院的前身是1979年11月成立的云南省工业干部学校。1983年8月，云南省政府决定将校名更改为“云南经济管理干部学院”。
1998年2月，云南省政府决定并与教育部批准，将云南经济管理干部学院与云南财贸学院合并，成立新的云南财贸学院。
1999年2月，新的云南财贸学院正式成立。
2006年2月，教育部正式批准云南财贸学院更名为云南财经大学。
以下是学院的本科专业设置：
财政与经济学院：经济学、经济学（数理经济）、财政学、财政学（注册税务师）。
金融学院：金融学、金融学（国际金融）、金融学（证券投资）、保险、金融工程。
商学院：工商管理、工商管理（跨国公司管理）、人力资源管理、劳动与社会保障、管理科学。
物流学院：物流管理、物流工程、物流工程（物联网工程）。
会计学院：会计学（注册会计师）、会计学（审计学）、会计学（国际会计）、会计学（会计信息系统）、财务管理。
旅游与服务贸易学院：旅游管理、会展经济与管理、财务管理（财务信息应用）、财务管理（金融财务与管理）、旅游管理（酒店管理）、旅游管理（餐饮管理）、英语（服务贸易英语）、市场营销。
信息学院：计算机科学与技术、信息管理与信息系统、物联网工程。
统计与数学学院：统计学、统计学（经济统计方向）、信息与计算科学、数学与应用数学。
外语外贸学院：英语（跨国银行管理）、商务英语、国际经济与贸易、国际经济与贸易（卓越人才教育培养计划）。
商学院：市场营销、电子商务、物流管理、物流工程。
城市与环境学院：工程管理（房地产经营管理）、城市规划、资源环境与城乡规划管理（国土规划与整治）、资产评估。
公共管理学院：行政管理、社会工作、公共事业管理、政治学与行政学。
传媒学院：新闻学（财经新闻）、新闻学（国际文化贸易）、广告学。
国际工商学院：国际金融（澳）、国际商务（美）、国际会计（美）、国际会计（澳）、国际商务英语（美）、项目管理（美）、理财学（澳）、金融学（金融服务）（英）。
现代设计艺术学院：艺术设计（视觉传达艺术设计、环境艺术设计、数字媒体艺术设计、动画艺术设计）。
东盟学院：财务管理（泰语、越南语、缅甸语方向）、汉语言（国际商务汉语）、越南语、泰语。
中华职业学院：财务管理（理财管理）、电子商务（网络营销）、工程管理（房地产开发与经营）、汉语言（商务文秘）、会计学（公司金融与财务信息管理）、会展经济与管理（会展管理与服务）、计算机科学与技术（网络应用技术）、旅游管理（商务与休闲旅游管理）、旅游管理（旅游企业管理）、市场营销（国际市场营销）、英语（国际金融英语）。
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