自1950年起，皖北高级农林学校正式创立。
1952年，原紫连山林校并入皖北高级农林学校，教育资源得到整合。
同年，皖北高级农林学校与紫连山林校合并后，更名为凤阳农业学校。
到了1960年，凤阳农业学校成功升级为凤阳农业专科学校。
在这一年，安徽农业专科学校、芜湖农业专科学校、屯溪茶叶专科学校以及宿县农业专科学校等三所学校的农学相关专业并入凤阳农业专科学校。
追溯至1958年，安徽农业专科学校建立。
1965年，安徽农学院（牧医系）与凤阳农业专科学校联合，共同组建了新的安徽农学院（凤阳分院）。
1981年，安徽农学院（淮北分院）并入安徽农学院（凤阳分院），并更名为安徽农学院（皖北分院）。
同年，安徽农学院（皖北分院）晋升为皖北农学院。
1985年，皖北农学院经过改革，转型为安徽农业技术师范学院。
2000年，安徽农业技术师范学院更名为安徽技术师范学院。
至2005年，安徽技术师范学院正式更名为现名的安徽科技学院。
目前，该校设有15个教学院部，开设59个本科专业，覆盖工学、农学、管理学、理学、文学、医学、法学、经济学等多个学科门类。学院已构建了以强势农科专业和新兴工科专业为核心，多学科交叉融合、协调发展的应用型学科专业体系。学院拥有2个国家级特色专业、4个国家级卓越工程师教育培养计划专业、6个省级特色专业以及3个省级重点学科。
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