滨州学院的前身可追溯至1958年成立的北镇师范专科学校。
到了1983年，学校更名为滨州师范专科学校。
在1999年至2003年期间，滨州供销技校、滨州教育学院、滨州广播电视大学、惠民师范、博兴师范等机构陆续并入滨州师范专科学校。
2001年9月30日，滨州市委、市政府作出决策，着手筹建滨州学院。
2002年8月8日，市委、市政府举办了滨州学院（筹）建设工程的奠基典礼。
2003年8月，学校完成了整体搬迁至新校址的工作。
2004年3月27日，滨州师范专科学校顺利通过了高校设置评议委员的评审。
同年5月17日，教育部正式批准滨州师范专科学校改建为滨州学院。
截至2014年2月，滨州学院设有以下21个院系部门：（政法系、中文系、历史系、外语系（大学英语教学部）、教师教育学院、经济管理系、数学系、光电工程系、化学工程系、生命科学系、建筑工程系、信息工程系（计算机基础教学部）、机电工程系、资源环境系、飞行学院、体育系（公共体育教学部）、音乐系、美术系、社科基础教学部、电气工程系、继续教育学院（远程教育中心））。
以下是各院系的专业设置：
- 政法系：思想政治教育（师范类）、公共事业管理（专科：法律事务）
- 中文系：汉语言文学（教师教育方向）、汉语言文学（高级文秘方向）（专科：文秘）
- 外语系：英语（教师教育方向）、英语（商务英语方向）、英语（翻译方向）、法语（专科：英语教育（师范类）、商务英语）
- 历史与社会学系：历史学（历史文化产业方向）、社会工作（专科：社会工作）
- 教育科学系：学前教育、小学教育（专科：学前教育、初等教育）
- 经济与管理系：信息管理与信息系统、财务管理、财务管理（中法合作）、市场营销（专科：工商企业管理、旅游管理、会计电算化、会计电算化（中法合作）、市场营销、市场营销（中法合作））
- 数学与信息科学系：数学与应用数学（教师教育方向）、数学与应用数学（经济数学方向）、统计学
- 物理与电子科学系：电子信息科学与技术、物理学本科专业（教师教育方向）、光信息科学与技术（专科：应用电子技术）
- 自动化系：电气工程与自动化、机械设计制造及其自动化、车辆工程（专科：电气自动化技术）
- 化学与化工系：化学工程与工艺、材料化学、应用化学（专科：应用化工技术）
- 计算机科学技术系：计算机科学与技术、通信工程（专科：计算机网络技术、软件技术）
- 生命科学系：生物科学、生物技术、食品质量与安全、园艺技术
- 建筑与城乡规划系：地理科学（旅游与城乡规划方向）、地理信息系统（空间信息与数字技术方向）、建筑学、土木工程
- 城市与环境系：安全工程、生态学、环境工程
- 体育系：体育教育（教师教育方向）、舞蹈学（体育方向）（专科：无）
- 音乐系：音乐学（教师教育方向）、音乐学、舞蹈学（专科：音乐教育）
- 美术系：美术学（教师教育方向）、艺术设计（环境艺术设计方向）、艺术设计（视觉传达设计方向）、艺术设计（传媒艺术设计方向）（专科：美术教育）
- 飞行学院：飞行技术（安全方向）、飞行技术（驾驶方向）、交通运输(民航机务工程方向)（专科：无）
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