上海大学自创立之初，便承载着国父孙中山的厚望。在孙中山先生关怀下，上大旨在成为一所贯彻国民党主张、肩负言论职责的革命学府。这里汇聚了众多共产党员，成为我党早期在上海的重要活动据点。即便在“四一二”反革命政变后，上大师生依然积极参与上海工人的三次武装起义，为革命胜利贡献了力量。
凭借其辉煌历史与重要地位，上大被誉为“五四运动有北大，大革命时期有上大”，流行一时的俗语更是将上大与黄埔军校、北京大学等名校相提并论，足见其在我国教育史上的崇高地位。上大培养出众多国共两党领袖，为国家发展做出了巨大贡献。
1922年春，王理堂牧师（烈士王霁初的伯父）在上海闸北青岛路青云坊（今青云路298号附近）创办东南高等师范专科学校，并担任首任校长。为加速培养共产党干部，中共总书记陈独秀决定将东南高等师范改建为上海大学，这一决定在党中央研究后得到通过。
1922年10月23日，东南高等专科师范学校正式改组为上海大学，邀请于右任担任校长。校舍为老式石库门2层楼房10余间，蔡元培、汪精卫、章太炎、张静江等知名人士担任校董，邵力子为副校长（共产党员，1924年4月起任代理校长），共产党人邓中夏任总务长，瞿秋白任教务长兼社会学系主任，校务工作主要由加入国民党的共产党人主持。
1923年至1925年间，孙中山、李大钊、廖仲恺、汪精卫等众多知名人士曾来校演讲，为上海大学的发展注入了强大动力。1924年1月，国民党第一次全国代表大会决定每月补助上大1000银元作为办学经费。1924年2月，学生人数从160人增至400人，学校迁至租界西摩路（今陕西北路）29号和时应里民房等处继续办学。
1925年5月30日，上海大学成为五卅运动的先锋队。1925年6月4日，学校被英国军队占领、封闭。7月，迁回闸北中兴路，设临时办事处继续招生，后租闸北青云路师寿坊（今青云路167弄位置）15幢民房为校舍。1925年9月10日，老上大重新开学上课，学生人数已增至800人。
1926年至1927年，上大师生积极参与各项革命活动，但在1927年5月3日，上海大学被国民党军警当局取缔封闭。部分师生转入国立武昌中山大学，新校址则改为国立劳动大学。
1958年，中国科学院华东分院创立了上海科学技术大学，与上海市共建，成为一所多科性重点大学。1959年，学校定名上海科学技术大学，由郭沫若书写校名，周仁担任校长。1960年，上海工业大学前身上海工学院创立。1972年，上海工学院与上海机械学院合并。1979年，上海工学院从上海机械学院分离，改名为上海工业大学。
1983年，原上海大学成立，下设多个学院。1994年，上海工业大学、上海科学技术大学、原上海大学、上海科技高等专科学校四校合并，成立新上海大学。四校合并时，江泽民同志题写校名，李鹏总理题词勉励，李岚清副总理也为学校题词。
1996年12月，上海大学通过“211工程”部门预审，次年通过“211工程”建设立项可行性论证，标志着上海大学进入“211工程”全面建设阶段。
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