武汉理工大学的悠久历史可追溯至清朝末年1898年，由湖广总督张之洞奏请清政府创办的湖北工艺学堂。2000年，经过国务院的批准，原属于教育部、交通部、中国汽车工业总公司的武汉工业大学、武汉交通科技大学、武汉汽车工业大学三校合并，形成了今天的武汉理工大学。
1948年4月，中共中央东北局和东北军区军工部党委决定在哈尔滨建立中国人民解放军东北军区军工部工业专门学校（即东北兵工专门学校），并由东北军区军工部部长何长工担任名誉校长。同年11月，何长工选址沈阳，学校由哈尔滨迁至沈阳。
1958年9月，建工部组建北京建筑工业学院。1949年3月，学校分为预科和本科，预科学制1年，本科4年。同年，东北兵工专门学校（部分）迁至沈阳沈河区青年公园湖旁，改建为东北建筑工程学校，后发展成为沈阳建筑材料工业学院。
1959年，沈阳建筑材料工业学院（本科部分）并入北京建筑工业学院。1960年，北京建筑工业学院成为建筑工程部部属重点院校。1969年10月，北京建筑工业学院南迁至湖南常德。1971年7月，学校迁至湖北武汉，与武汉建筑工程学校（原武汉城市建设学院）合并，更名为湖北建筑工业学院。
1978年2月，湖北建筑工业学院被列为全国重点大学，重新划归国家建筑局领导，并更名为武汉建筑材料工业学院。1980年，经国务院批准，在原北京建筑工业学院旧址成立北京研究生部。1981年，学校获得无机非金属材料学科博士学位授予权和结构工程等7个学科硕士学位授予权，成为首批获得博士学位授予权的高校。
1985年8月，武汉建筑材料工业学院更名为武汉工业大学。1986年，“结构工程”学科获批为博士学位授予权学科，增加8个硕士学位授予权学科，获得正、副教授任职资格评审权。1987年，材料复合新技术国家重点实验室获得国家计委批准。1988年，无机非金属材料学科被批准为首批国家重点学科，1989年该学科获准设立博士后流动站。
1997年9月，武汉工业大学通过“211工程”建设项目立项审核，成为首批211工程重点建设大学。1998年，武汉工业大学由建材总局所属划归为教育部，成为教育部直属重点大学。
1946年，国立武昌海事职业学校、广东省立潮汕高级商船职业学校（部分）合并组建国立武昌海事学校。1949年，中南交通学院成立，刘惠农同志任院长，曹海波为副院长。1952年，大连海运学院、上海海运学院等高校船舶专业并入中南交通学院。1954年，大连海运学院（航运专业）并入中南交通学院，中南交通学院更名为武汉河运学院。
1957年，武汉交通学院更名为武汉水运工程学院。同年，全国多所高校水运专业并入武汉水运工程学院。1963年，上海海运学院内燃机专业、大连海运学院船机等专业并入武汉水运工程学院。同年，水运管理和水运经济专业调整到上海海运学院。1981年，船舶与海洋工程流体力学等4个学科获得硕士学位授予权。1984年，船舶与海洋工程流体力学获得博士学位授予权。
1992年7月，武汉河运专科学校（前身为国立潮汕高级商船学校）并入武汉水运工程学院。1993年11月，武汉水运工程学院更名为武汉交通科技大学，在全国范围内开始一本招生。1996年12月，交通部与湖北省签署共同建设武汉交通科技大学的协议。1998年，武汉交通科技大学部分学科通过211工程预审。
1958年10月27日，武汉工学院创建。1960年，华中工学院（华中科技大学前身）汽车制造专业并入武汉工学院。1961年，湖北工学院、湖北化工学院并入武汉工学院。1970年，武汉工学院与湖北农业机械专科学校合并组建湖北农机学院。1979年，武汉工学院恢复名称。1983年9月，学校由机械部划归为中国汽车工业总公司领导。1995年，武汉工学院更名为武汉汽车工业大学。1997年，武汉汽车工业大学通过了国家“211”工程重点学科部门预审。
截至2013年，学校共设有23个学院、2个继续教育学院、1个职业技术学院，包括但不限于：
武汉理工大学材料科学与工程学院、武汉理工大学交通学院、武汉理工大学管理学院、武汉理工大学汽车工程学院。
武汉理工大学机电工程学院、武汉理工大学物流学院、武汉理工大学信息工程学院、武汉理工大学自动化学院。
武汉理工大学计算机科学与技术学院、武汉理工大学理学院、武汉理工大学能源与动力工程学院、武汉理工大学航运学院。
武汉理工大学土木工程与建筑学院、武汉理工大学化学工程学院、武汉理工大学资源与环境工程学院、武汉理工大学经济学院。
武汉理工大学文法学院、武汉理工大学艺术与设计学院、武汉理工大学政治与行政学院、武汉理工大学外国语学院。
武汉理工大学国际教育学院、武汉理工大学体育部、武汉理工大学马克思主义学院。
网络继续教育：武汉理工大学继续教育学院、武汉理工大学网络教育学院。
职业技术教育：武汉理工大学职业技术学院。
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