1958年，山东中医学院正式创立。
（1978年），该校被国家定位为全国重点建设的中医院校。
（1981年），山东中医学院被山东省政府认定为省属重点院校，并获得国务院学位委员会批准，成为全国高等中医药院校中首批授予学士和硕士学位的单位。
（1986年），学校成功获得博士学位授予权。
（1996年），经原国家教委批准，学校更名为山东中医药大学。
（1998年），山东中医药大学设立首个博士后科研流动站，并在同年被国务院学位委员会批准为首批临床专业硕士学位授予试点单位。
（2000年），学校获得批准成为临床专业博士学位授予试点单位。
（2007年），山东中医药大学从济南市历下区迁至长清大学科技园，成为山东省唯一一所独立设置的医药科大学，并且在教育部本科教学工作水平评估中获得优秀评级。
（2012年），学校被选为山东特色名校工程首批5所应用基础型特色名校之一。
以下是山东中医药大学基础医学院的部分专业设置：
- 中医学（七）传统型中医
- 中医学（七）中西医结合
- 中医学（七）针灸推拿
- 中医学（七）医药结合
- 中医学（七）中医学
- 中医学（五）中医学
- 中医学（五）全科医学
- 中医学（五）骨伤科学
- 中医学（五）中医药文献信息工程
- 中医学（五）医药法学
- 中医学（五）中西医结合
此外，还有以下本科专业：
- 制药工程（生物制药）
- 针灸推拿（运动医学）
- 护理学
- 人文社会科学
- 外国语学院 英语
- 信息管理与信息系统（信息管理学院）
- 生物医学工程（理工学院）
- 体育艺术学院
- 国际教育学院
- 继续教育学院
以上是山东中医药大学的专业设置概览。
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