东北师范大学，其源头可追溯至中国共产党在东北地区创办的首所综合性大学——东北大学。
1946年元旦之际，东北局指示著名文学家舒群创办“东北公学”，同年2月，该学校秉承“依照民主政府建设新东北之方针，广纳各级学员，培养行政技术及师资等实用人才”的宗旨开始招生。不久，东北局决定将“东北公学”更名为“东北大学”，并由张学良将军的胞弟、东北行政委员会副主席张学思兼任校长，校址位于本溪。
1946年3月15日，学校迁至安东（现丹东市），随后历经通化、梅河口、吉林，于4月26日抵达长春。学校选址在长春著名的“海上大楼”。5月，因国民党反动军队进犯公主岭，学校再次北撤。27日抵达哈尔滨市，部分师生留下接收哈尔滨医科大学，余下师生继续北撤。1946年6月1日，最后一批师生抵达北满根据地佳木斯市，学校在“满赤医院”开启了新的篇章。在为期3个月、行程1500余公里的北撤过程中，学校队伍不断壮大，干部和教师始终与同学们同甘共苦，展现了他们对革命事业的无限忠诚，体现了党的干部的优秀品质和作风。
1946年8月，张如心率领的延安大学和华北联合大学的百余名教师、干部抵达哈尔滨市，加入东北大学，增强了学校的实力，形成了一支学术水平高、实力雄厚的教师、干部队伍。张如心先后担任学校副校长、校长。
1946年，东北大学新生在哈尔滨市的东大办事处门前集合前往佳木斯。1947年5月9日深夜，东北大学学生、刁翎县土改工作团团员李雷被土匪杀害，中共刁翎县委为他修建了烈士墓。1947年5月12日，东北大学学生张建堂在参加土改时，与土匪激战中光荣牺牲，中共刁翎县委为他修建了烈士墓，并将刁翎村改名为建堂村。1947年，东北大学学生在佳木斯过着艰苦的生活。1948年4月，东北大学宣传队为群众演剧。1948年4月，东北大学师生300余人下乡参加土地改革。1948年5月，东北大学学生绘制的解放战争发展形势图在校门口竖立。
1948年7月，东北局决定将东北大学迁至吉林市，与党在吉林市创建的吉林大学合并，更名为东北大学。1949年2月，长春大学、沈阳东北大学、长白师范学院文、理、法三个学院及先修班教职员与学生全部合并到东北大学。1949年7月，学校由吉林市迁至长春市。
1949年3月，东北大学学生刘自然率东北学生代表团出席第十四届全国学生代表大会。1949年10月1日，东北大学师生参加庆祝中华人民共和国成立大会。1949年11月6日，东北大学青年团、教工会、学生会召开庆祝党公开大会。
1950年4月，为适应国家教育事业发展的需要，学校更名为东北师范大学，归属教育部，成为一所以培养新型中学师资为目标的高等师范院校。1952年，中国无产阶级革命家、著名教育家和社会科学家成仿吾到该校担任党委书记兼校长。成老到校后，带领全校干部、教师实行正规化办学，着力教学改革和教材建设，加强科学研究的领导和管理，充实教师队伍，弘扬延安精神，推动学校长足发展，使其成为当时中国最有影响和最具发展实力的师范大学之一。
1958年，东北师范大学下放归吉林省领导，同年10月学校更名为吉林师范大学。在十年动乱期间，学校遭受严重破坏，但广大师生在风雨中同舟共济，为学校后来的发展保留了力量。
1978年2月，经国务院批准，学校重新划归教育部领导。1980年8月，经教育部批准，学校恢复“东北师范大学”的校名。
1996年，学校被确定为国家“211工程”首批重点建设的大学；1999年，学校顺利完成新一轮内部管理体制改革，建立了与教育规律和经济规律相适应的管理体制和运行机制；2000年，启动净月校区建设，进一步增强学校的办学实力和整体竞争力；同年，学校被批准试办研究生院，成为全国53所拥有研究生院的高等院校之一。
1996年，江泽民总书记为东北师范大学题词：“办好师范教育，培养优秀教师，提高民族素质”，这是党和人民对东北师范大学的深切期望。
2007年2月4日，中共中央政治局常委、国务院总理温家宝和国务委员陈至立，在吉林省委书记王珉，省委常委、长春市委书记王儒林的陪同下来到东北师范大学，与同学们热烈讨论师范教育问题，并首次就免费师范生教育问题与同学们交流意见。
2007年5月，国务院转发《教育部直属师范大学师范生免费教育实施办法（试行）》，东北师范大学承担起首届免费师范生教育的重任，学校将继续发扬优良的革命传统，为中国的教育事业贡献力量。
截至2013年，学校设有185个硕士学位授权点、133个博士学位授权点、34个硕士学位授权一级学科，22个博士学位授权一级学科，16个博士后科研流动站；1个教育博士专业学位点，17个硕士专业学位点；5个二级学科国家重点学科，8个“211工程”重点学科建设项目，21个“十二五”吉林省一级学科优势特色重点学科；历史、中文、生物等3个学科是国家文科、理科基础学科人才培养和科学研究基地。该校学科点覆盖了除军事学和医学以外的11个学科门类，形成了综合性学科格局。
博士一级学科授权点：哲学、应用经济学、马克思主义理论、教育学、心理学、体育学、中国语言文学、外国语言文学、数学、物理学、化学、地理学、生物学、生态学、统计学、环境科学与工程；
硕士一级学科授权点：法学、政治学、社会学、新闻传播学、考古学、中国史、世界史、计算机科学与技术、城乡规划学、软件工程、草学、工商管理、公共管理、图书情报与档案管理、艺术学理论、戏剧与影视学、美术学。
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