1971年，我国教育工作会议作出重大决策，将上海交通大学内燃机车等3个专业以及同济大学铁道工程专业划归上海铁道学院，并正式更名为华东交通大学。同年9月22日，国务院、中央军委联合决定将该校迁移至江西省南昌双港。
1973年，上海铁道学院与同济大学、上海交通大学相关合并专业的招生任务以“华东交通大学”校名下达，标志着“华东交通大学”首次以新校名进行招生。
1975年，华东交通大学申请将工民建专业纳入正式招生计划，这是学校在南昌筹备阶段首次进行招生。
1978年，中央同意原上海铁道学院不再迁移，华东交通大学继续在南昌建校，由原铁道部和江西省共同领导，以原铁道部为主导。
在那个时期，全国400多所高校经过“撤、并、改”后仅剩300余所，华东交通大学成为少数增设的高校之一，旨在打造一所产、学、研一体化的“社会主义新型大学”的典范。学校第一期工程被纳入国家大中型建设项目。
从1979年至1984年，学校相继建立了建筑工程系、机械工程系、电气工程系、经济管理系和基础课部等，办学层次也从本科教育拓展至硕士研究生教育。
2000年，学校体制转变为“中央与地方共建、以地方管理为主”，成为江西省重点建设的高等院校。
2001年至2003年，学校周边的江西省煤炭干部（技工）学校、南昌铁路机械学校等教育资源相继并入，校区面积扩大至2800亩，总建筑面积达到66.7万平方米，仪器设备总值达到2.16亿元。
2013年8月，经国务院学位委员会第三十次会议审议批准，学校被增列为博士学位授予单位，成为江西省首批通过博士学位授予权立项建设验收的工科院校。这一里程碑标志着该校已构建起从高职高专、大学本科、硕士研究生到博士研究生的完整人才培养体系，办学层次和质量实现了新的飞跃。
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