自1894年清政府批准设立北洋医学堂以来，河北医科大学的历史沿革见证了我国医学教育的发展。
1913年，直隶公立医学专门学校在保定成立，标志着医学教育向专业化迈出了重要一步。
到了1921年，该校并入河北大学，成为其医科的一部分。
1932年，河北大学停办后，独立设置为河北省立医学院。
然而，1937年抗日战争的爆发迫使学校停办，这一停就是长达9年的时间。
1947年，学校从保定迁移至天津。
天津解放后的1949年，学校被天津市人民政府接管，并于4月转由华北人民政府卫生部领导，更名为河北医学院。
1952年，河北医学院从天津迁回保定。
1958年，再次迁移，河北医学院由保定迁至石家庄。
1970年，天津中医学院（前身为1956年建立的河北中医学校，后历经更名）迁至石家庄与河北医学院合并，成立河北新医大学，设有医学和中医两个专业。
1979年8月，河北省委决定恢复河北医学院名称，同时组建河北中医学院。
1949年成立的鞍山卫生学校，后更名为鞍钢卫生学校、华山冶金医学专科学校，1988年迁至石家庄，改名为石家庄医学高等专科学校。
1995年5月，河北省政府决定将河北医学院、河北中医学院、石家庄医学高等专科学校合并，组建为河北医科大学。
2001年，经河北省政府批准，成立“河北医科大学沧州分校”，但2004年后该分校被取消。
2005年，河北医科大学在教育部本科教学评估中取得优异成绩。
2013年4月18日，根据教育部教发函批示，原河北中医学院部分恢复独立建制。
河北医科大学设有基础医学院、公共卫生学院、药学院、临床学院等主要院系。
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