成立于1959年的安徽中医学院，于2000年经省政府批准，将省医药学校并入其中。该校在2005年的国家教育部本科教学工作水平评估中荣获良好成绩，并被授予安徽省第七届文明单位称号。2006年，学院在安徽省大学生思想政治教育工作评估中表现优异。作为一所特色鲜明的中医药高等学府，安徽中医学院涵盖了理学、工学、管理学、经济学等多学科，是安徽省中医药高等教育、临床和科研的核心基地。
安徽中医学院现有教职工1700余名，其中包括教授、主任医师87人，副教授、副主任309人，博士生导师7人，硕士生导师80余人。该校已构建起一支实力雄厚、结构合理、严谨治学的高水平师资队伍，并有来自国内外30名知名专家学者担任客座教授。学院建立了新安医学省级创新团队和现代中药研发产业创新团队，后者入选省首批“115”产业创新团队。
校园占地总面积328亩，分为东西两个校区。目前，安徽中医学院有在校本专科生9000人，硕士生525人，留学生（含台湾学生）72人，成教生2000余人。学院设有18个硕士点，4个博士生联合培养基地，以及26个本科专业（方向）。
学院设有中医临床学院、中西医结合临床学院、针灸骨伤临床学院、药学院、护理学院、经济管理学院、医药信息管理学院等7个二级学院和一个研究生部。自1959年创立以来，学院秉持“南新安、北华佗”的医学传统，经过40余年的发展，目前拥有7个教学系（部）、22个本科专业（方向）和11个专科专业。学院还设有两所附属医院、一所国医堂门诊部、四个中医药高科技研究所、一所成人教育学院，以及近百所实践教学实习基地。
安徽中医学院拥有一个国家中医药重点学科、三个省级重点学科，4个博士生联合培养基地，12个硕士学位授予点。图书馆藏书量达31万册。学院积极开展合作办学，与合肥工业大学联合创办制药工程专业，与北京、广州等地的中医药大学联合培养博士生，并与合肥西区四所高校实现“优势互补，资源共享”。
自1996年起，学院获准对国外招收留学生，1997年起对港、澳、台地区招生。目前已形成以本科教育为主，研究生教育快速发展，成人教育和留学生教育并存的高等教育体系。学院现有国家教育部高等学校特色专业（中医学、中药学）、1个国家中医药管理局重点建设学科（中医内科）、3个省级重点建设学科、11个国家中医药管理局重点建设专科、5个省级重点专科、6个省级重点实验室及工程研究中心、2个省级教改示范专业、2个省级基础课实验教学示范中心、6门省级重点课程、14门省级精品课程。
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