1937年12月31日，国立贵阳医学院筹备委员会正式成立，李宗恩教授被任命为筹备委员会主任委员。
1938年1月1日，筹备委员会在汉口设立，教育部聘请了原贵州省教育厅厅长张志韩及教育部官员杭立武担任筹备委员。
到了1938年3月1日，国立贵阳医学院正式宣告成立，教育部聘请李宗恩博士担任首任院长。
1947年7月，李宗恩院长上调至北京协和医学院担任院长一职，教育部随即任命朱懋根教授为贵阳医学院新任院长。在那个时期，贵阳医学院是全国仅有的九所国立医学院校之一。
1950年12月24日，按照国家统一规定，学校更名为“贵阳医学院”，并划归贵州省人民政府管理。
根据2014年学校官网信息，贵阳医学院设有20个教学单位，包括基础医学院、临床医学院、药学院、公共卫生学院、成人继续教育学院、研究生院、护理学院、医学检验学院、医学影像学院、口腔医学院、运动与健康学院、医药卫生管理学院、医学人文学院、海外教育学院、外国语学院、社会科学教学部、法医学系、麻醉学系等。截至2013年底，学校共有直管附属医院7所，其中1所在筹备中。
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