重庆医科大学，前称重庆医学院，其发展历程可追溯至1956年。是年，根据中央决策，上海第一医学院部分迁至重庆，成立上海第一医学院重庆分校，后独立设置为重庆医学院。到了1985年，经教育部批准，重庆医学院正式更名为重庆医科大学。该校历史上曾隶属于卫生部、四川省人民政府及重庆市人民政府。2002年，重庆职工医学院与重庆中医学校并入重庆医科大学，分别成立了应用技术学院和中医药学院。
学院设置丰富，包括重庆医科大学第一临床学院、重庆医科大学第二临床学院、重庆医科大学儿科学院、重庆医科大学口腔医学院等。
此外，还有重庆医科大学第五临床学院、重庆医科大学检验医学院、重庆医科大学检验基础医学院、重庆医科大学中医药学院等。
在工科学院方面，设有重庆医科大学生物医学工程学院，而在人文与管理学科上，则有重庆医科大学公共卫生与管理学院、重庆医科大学药学院、重庆医科大学护理学院。
专业学院还包括重庆医科大学麻醉学系、重庆医科大学医学影像系、重庆医科大学卫生学校以及重庆医科大学生命科学研究院。
人文与社会科学领域，重庆医科大学设有外国语学院、重庆医科大学思想政治教育学院、重庆医科大学信息管理系等。
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