學院前身是1958年建立的南京醫學院徐州分院。
1959 年新海連醫學專科學校並入，
1960年，經江蘇省人民政府批準，正式定名為徐州醫學院。
1985年開始碩士研究生教育。
1996年開始相繼與中科院上海藥物所、大連醫科大學和中國科技大學聯合培養博士生。
2000 年，徐州衛生學校並入徐州醫學院。
2005 年 ，學校以“優秀”成績通過了國家教育部本科教學工作水平評估。
2013年，學校成為博士學位授予單位。
學術研究
科研成果
截至2013年12月，學校獲各級各類科研課題1367項，課題經費 6587.84 萬元，其中國家自然科學基金資助 162項，重點項目3項，其他省部級以上課題近100項。獲衛生部科技進步三等獎3項，省部級科技進步獎48項；近3年共發表論文2909 篇，其中中文核心期刊發表論文595篇，被 SCI、EI、CPCI-S論文收錄近600篇，單篇論文最高影響因子達 7.535 。2007年，學校有2篇論文入選中國科學技術信息研究所發布的第壹屆“中國百篇最具影響優秀國際學術論文”，是全國唯壹壹所有2篇論文同時入選的獨立設置的醫學院校。獲國家科技進步獎二等獎和自然科學獎二等獎2項，省級科技進步獎壹等獎、省級教學成果獎特等獎等38項省部級成果獎。
科研機構
截至2013年12月，學校擁有省級重點實驗室和科研平臺5個，省級研究所10個。
江蘇省麻醉學重點實驗室
江蘇省腦病生物信息重點實驗室
江蘇省麻醉與鎮痛應用技術重點實驗室
江蘇省腫瘤生物治療重點實驗室
江蘇省腫瘤生物治療工程實驗室
江蘇省麻醉醫學研究所
徐州醫學院腫瘤防治研究所
徐州醫學院心血管病研究所
徐州醫學院生殖遺傳研究所
生物化學與分子生物學研究中心
徐州醫學院造血幹細胞移植中心
徐州醫學院神經生物學研究中心
徐州醫學院新藥及臨床應用研究中心
徐州醫學院統計分析中心
徐州醫學院神經精神病學研究中心
學術資源
《徐州醫學院學報》創刊於1979年，16開，季刊，限國內發行；1986年始交郵局公開發行，仍為季刊，16開；1997年改為雙月刊；1998年改為A4開本，仍為雙月刊。學報自創刊至今，始終按照黨的出版工作方針出刊，註重內涵建議，緊緊圍繞提高學報質量這個中心，瞄準學院省重點學科 “ 麻醉學 ” 和 “生物化學” ，開辟專欄，全面報道學院醫學科學研究狀況。
在省、市及全國舉行的各種評比中連連獲獎，特別是2004年獲得教育部科技司頒發的“優秀編輯出版質量獎”，2005年獲中國高等學校自然科學學報研究會頒發的“高校科技期刊先進集體”榮譽稱號。
該刊為國家科技部確定的中國科技論文統計源期刊，中國科技核心期刊，是首批進入《中國科技期刊（光盤版）》的成員期刊，並為美國《化學文摘》（CA）、俄羅斯《文摘雜誌》（AJ）以及《中國科學引文數據庫》（CSCD）、《中國科技論文與引文數據庫》（CSTPCD）、《中國學術期刊綜合評價數據庫》、《中國生物醫學文獻光盤數據庫》（CBMdisc）、《中文生物醫學期刊文獻數據庫》（CMCC）等收錄。多次在教育部及教育廳組織的期刊評比中獲獎。
截至2014年，圖書館擁有紙質圖書35.5萬冊、電子圖書約45.6萬冊；中文期刊全文數據庫2個，收錄9000余種中文期刊；優秀博碩士論文數據庫1個；外文全文期刊數據庫3個，收錄外文期刊總數8201種，其中50%為自然科學期刊，其中醫學期刊1774種。二次文獻數據庫3個，自建館藏外文期刊全文數據庫、本院碩士論文數據庫和隨書光盤數據庫。自建視聽網站，收藏醫學視聽教材1200余種，外文英語視聽教材近萬個教學單元，網上資源24小時開放。
辦學條件
院系設置
截至2013年12月，學院設有12個系（部、院）。學校本科專業已經發展到臨床醫學、麻醉學、醫學影像學、藥學、口腔醫學、護理學、生物醫學工程、公共事業管理、醫學信息學等20個專業，涵蓋了醫、理、工、管4個專業門類。
臨床醫學系麻醉學系醫學影像學系藥學系公共衛生學系護理學系基礎醫學部社會科學部研究生部體育部臨床學院成人教育學院
師資力量
截至2013年12月，學校有教職工1454人，其中在編專任教師989人，其中教授203人、副教授474人，博士248人、碩士558人，博士生導師19人 、碩士生導師 502人。有“全國優秀教師”5人，國家級“有突出貢獻中青年專家”1人，享受國務院政府特殊津貼29人次；教育部優秀骨幹教師項目資助2人。江蘇省“有突出貢獻中青年專家”13人；江蘇省政“高層次人才培養工程”培養人選47人次，江蘇省高校“青藍工程”學術帶頭人培養人選9人次，江蘇省優秀青年骨幹教師 35人次；江蘇省優秀教育工作者3人，江蘇省教學名師2人，江蘇省勞動模範 6 人，江蘇省“紅杉樹園丁獎金獎2人、銀獎2人。
教學建設
截至2013年12月，學校擁有國家級特色專業建設點4個，省級特色（品牌）專業6個。江蘇省科技創新團隊1個，國家和江蘇省優秀教學團隊2個。省級精品課程9門，國家級規劃教材和省級精品教材（立項）19部。擁有國家級人才培養模式創新實驗區1個，省級實驗教學示範中心和實踐教育中心建設點11個；擁有第壹批國家級“卓越醫生教育培養計劃”項目3項，是第壹批臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校。
學校畢業生就業率始終保持在95%以上，首屆畢業留學生執業醫師考試通過率為100% 。2005年，學校以“優秀”的成績通過了教育部本科教育工作水平評估。
：麻醉學、藥學、臨床醫學、醫學影像學
生物醫學工程、醫學影像學、藥學、護理學、麻醉學
：徐州醫學院麻醉學專業教學團隊
：麻醉學專業人才培養創新
卓越醫生教育培養計劃項目:五年制臨床醫學人才培養模式改革試點、農村訂單定向免費醫學教育人才培養模式改革試點、“3+2”
徐州醫學院麻醉學專業教學團隊、徐州醫學院藥學教學團隊
：
基礎醫學實驗教學示範中心醫學生物化學與分子生物學教學示範中心預防醫學基礎實驗教學中心診斷學基礎課教學實驗中心機能學試驗中心醫學工程實驗教學中心形態學實驗教學中心藥學實驗中心護理學實驗教學中心醫學檢驗,實驗教學中心虛擬仿真,實驗教學中心
麻醉藥理學、麻醉解剖學、醫學生物化學與分子生物學、人體生理學、病原生物學、臨床麻醉學、臨床藥理學、醫學統計學、人體生理學
學科建設
截至2013年12月，學校擁有國家級重點學科建設培育點1個；省級重點學科6個，省優勢學科群1個，“十二五”高校重點專業4個，省級醫學重點學科和重點臨床專科19個，江蘇省優秀學科梯隊1個，獲中央財政支持地方高校發展專項資金建設項目23項。擁有2個博士學位授權壹級學科，碩士學位授權壹級學科和臨床醫學專業學位授權點，具有碩士研究生推免權，
序號學科代碼學科名稱國家重點學科,（培育）建設點1100217麻醉學江蘇省重點學科1100217麻醉學2071010生物化學與分子生物學3100201內科學4100210外科學5100202兒科學
序號壹級學科代碼學科名稱壹級學科博士點11051臨床醫學20710生物學壹級學科碩士點11051臨床醫學21001基礎醫學30710生物學41007藥學51004公共衛生與預防醫學
附屬醫院
徐州市第二人民醫院（徐州醫學院附屬醫院）
徐州礦物集團總醫院（徐州醫學院第二附屬醫院）
徐州醫學院附屬第三醫院（原徐州市鐵路醫院）
連雲港市第壹人民醫院（徐州醫學院附屬連雲港醫院）
淮安市第二人民醫院（徐州醫學院附屬淮安醫院 ）
中國人民解放軍第九七醫院（徐州醫學院附屬淮海醫院）
徐州市第壹人民醫院（徐州醫學院附屬徐州市立醫院）
徐州市婦幼保健院（徐州醫學院附屬徐州婦幼保健院）
徐州市口腔醫院（徐州醫學院附屬徐州口腔醫院）
國際交流
截至2013年12月，學校與美國哈佛大學醫學院、麻省總醫院、威斯康星大學 醫學院、德克薩斯州帕克醫學院、紐約州立大學醫學研究中心、維也納醫科大學等國外醫學院校、科研院所建立了相對固定的學術交流關系。學校每年都派送教師赴國外學習進修，參加國際學術會議，同時又接收了壹批又壹批國外學者的來訪，在多個學科進行學術交流，並主辦了多次國際學術會議，提高了學校的學術地位和辦學水平，擴大了學校對外交流的渠道和影響。
隨著學院國際教育開展的進壹步深入，截至2013年12月，學院已有來自尼泊爾、印度和巴基斯坦三個國家的五十壹名留學生。他們也成了校園裏壹條亮麗的風景線。
1美國
哈佛大學醫學院
Harward University Medical College
學術交流2麻省總醫院學術交流,互訪3威斯康星大學醫學院合作科研,人員交流,互訪4德克薩斯,帕克醫學院學術交流5紐約州立大學醫學研究中心人員交流,學術交流,互訪6愛荷華大學,醫學院學術交流7奧地利維也納醫科大學學術交流,人員交流
學校領導
黨委書記
陳貴州
院長,黨委副書記吳永平黨委副書記高嘉璽黨委常委,副院長趙世鴻黨委常委,副院長鄭葵陽副院長,藥學院院長印曉星副院長,附屬醫院院長徐開林黨委常委,紀委書記季紅
文化傳統
校訓
以德載醫，
儒家經典《大學》開宗明義：“大學之道，在明明德，在親民，在止於至善。”近代著名教育家唐文治老先生也有壹句教育名言：“欲成第壹等學問、事業、人才，必先砥礪第壹等品行”。徐州醫學院的校訓“以德載醫，博學創新”中的“以德載醫”，就蘊含了 “壹等學問必先砥礪壹等品行”這個道理。學會做人是根本。其次要學會如何做有用的人，學好本領，將來用醫學知識回報社會；然後是學會做成功的人。
元代著名學者許明奎的 《勸忍百箴》篇中格言：“立身百行，以學為基。”中國古代還有壹句名言：“讀萬卷書，行萬裏路。”尤其是醫學專業知識更新迅速，從事醫療衛生職業更需要保持終身學習。徐州醫學院的校訓“以德載醫，博學創新”中的“博學創新”，就飽含了“學以致業”的道理。
校歌
徐海大地故黃河畔匯聚著壹代青年
救死扶傷 報效祖國
我們重任在肩在肩 艱苦奮鬥 團結進取
我們的傳統 勤奮嚴謹
求實創新 我們牢記心間啊
啊 在這飛翔的時代 我們將紅火的青春無私地奉獻 無私的奉獻 無私的奉獻徐
海大地故黃河畔匯聚著壹代青年
救死扶傷 報效祖國
我們重任在肩在肩 努力學習 又紅又專
奮力拼搏向前 根深葉茂
桃李滿園母親總在身邊啊
在這飛翔的時代 我們將紅火的青春無私地奉獻 無私的奉獻 無私的奉獻
校區分布
共有四個校區：
1.位於徐州市鼓樓區銅山路209號。
2（老校區）位於徐州市泉山區淮海西路84號 。
3位於徐州市鼓樓區大廟鎮上山村。
4.（民辦二級學院）位於徐州市泉山區韓山路。
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