广东药科大学共有14个学院,包括:医药商学院;医学工程学院;生命科学和生物制药学院;食品科学学院;护理学院;医学和化学工程学院;国际教育学院;外国语学院;卫生学院和药物科学院;公共卫生学院;基础学院;继续教育学院;临床医学院;中医学院;医药经济学院等院系。
广东药科大学的核心专业有:化学工程与工艺、生物医学工程、制药工程、食品质量与安全、国际经济与贸易、信息管理与信息系统、公共事业管理、市场营销、人力资源管理、电子商务、物流管理、食品科学与工程、计算机科学与技术、生物制药、中药制药、保险、英语、高分子材料与工程、应用化学、电子信息工程等。数字媒体技术、康复治疗、药事管理、药物化学、生物科学技术、生物科学、预防医学、药物制剂、中药、药学、临床医学、中草药栽培与鉴定、卫生检验、中药资源与开发、护理学、临床药学等专业学科。
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