上海理工大学有20个学院，包括机械工程学院；电气和电子工程学院；生态与工程学院；外国语学院；理学院；香料技术与工程学院；材料与工程学院；化学与环境工程学院；城市建设与安全工程学院；轨道交通学院；体育部；计算机科学与信息工程学院；经济与管理学院；人文学院；艺术与设计学院；创新工程学院；高职院校；继续教育学院；马克思主义教育部和其他学院。
上海理工大学的核心专业有：材料科学与工程、工商管理(国内外)、信息管理与信息系统、财务管理、会计、市场营销、劳动与社会保障、会展经济与管理、机械设计与制造及其自动化、材料成型与控制工程、电气工程及其自动化、计算机科学与技术、环境工程、安全工程、生物工程、电子信息工程、机械、电气信息、过程与控制工程、自动化、软件工程、制药工程、热能与动力工程、网络工程、建筑、机械、 化学、园艺、园艺、国际经济与贸易、文化产业管理、工商管理、社会工作、化学(国内外)、生物技术、应用化学、数学与应用数学、艺术设计、英语、德语、信息显示与光电技术，以及化学与工艺、轻化工、食品科学与工程、工商管理、电气信息、材料物理、复合材料与工程、通信工程、给排水工程等几十个本科专业。
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