黑龙江八一农垦大学有会计学院等15个学院；食品科学学院；工程学院；经济与管理学院；思想政治理论课教研室；社会科学学院；动物科学与技术学院；生命科学与技术学院；理学院；应用技术学院；高等职业技术学院；继续教育学院；军事体育部；农学院；信息技术学院等。
黑龙江八一农垦大学专业为通信工程、计算机科学与技术、交通运输技术、种子科学与工程、建筑环境与设备工程、电子信息工程、电气工程及其自动化、包装工程、工业设计、制药工程、农业电气化及其自动化、食品科学与工程、生物工程、食品质量与安全、草原学、植物学、园艺学、水土保持与荒漠化治理、动物医学、动物科学、资源与环境、植物保护、动物制药、国际经济与贸易、农业机械化及其自动化、农学、 风景园林、交通运输、土木工程、市场营销、农林经济管理、财务管理、会计学、人力资源管理、公共事业管理、物流管理、社会工作、政治学与行政学、环境科学、信息与计算科学、生物科学、生物技术、英语、英语
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