安徽医科大学现有12个学院,包括现有的基础医学院;公共卫生学院;口腔医学院;卫生管理学院;药学院;护理学院;生命科学学院;社会科学学院;公立基础学院;研究生院;国际教育学院;成人教育学院和其他学院。
安徽医科大学的核心专业有:基础医学、预防医学、临床医学、麻醉学、医学影像学、医学检验、口腔医学、药学、护理学、康复治疗学、中医学、卫生学检验、食品质量与安全、生物医学工程、公共事业管理、法学、应用心理学、生物技术、劳动与社会保障、临床药学、信息管理与信息系统等。
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