同济大学有建筑与城市规划学院等36个学院；土木工程学院；机械与能源工程学院；经济与管理学院；外国语学院；环境与工程学院；材料与工程学院；电子信息工程学院；人文学院；法学院；政治和国际关系学院；理科(分为数学系、物理系、化学系)；海洋地球科学学院；汽车学院；交通工程学院；中德学院；钟毅学院；软件学院；传播与艺术学院；电影学院；航空航天和力学学院；医学院；生命科学与技术学院；口腔医学院；知识产权研究所；体育系；铁道城市轨道交通研究所；中德工程学院；职业和技术教育学院；高等技术学院；女子学院；中国法学院；浙江学院；设计创意学院；中西学院和其他学院。
同济大学的核心专业有：临床医学、汽车服务工程、热能与动力工程、电气工程及其自动化、计算机科学与技术、电气信息工程、自动化、通信工程、软件工程、建筑学、城市规划、建筑环境与设备工程、口腔医学、护理学、临床医学与医学技术、工程无机非金属材料工程、金属材料工程、高分子材料与工程、材料科学与工程、设计、机械电子工程、电气信息、测绘、交通运输、给排水工程、 环境与安全、物流工程、工程力学、航空航天、化学工程与工艺、交通工程、海洋工程、农业园林、经济学、国际经济与贸易、金融学、经济学、物流管理、土地资源管理、管理科学与工程、工商管理、旅游管理、工程管理。 桥梁与河流穿越工程、土木工程、测绘工程、园林工程、电气工程及其自动化、材料、机械、车辆工程、历史建筑保护工程、建筑设施智能技术、港口航道与海岸工程、交通运输、飞机制造工程、工程力学、机械设计制造及其自动化、电子信息工程、土木工程、环境工程、海洋科学、环境科学、统计学、生物科学、生物技术。电子科学、数学、物理、化学、生物科学、海洋科学、电子信息科学、环境科学、生物信息学、地质工程、能源动力、公共管理、文化产业管理、信息管理与信息系统、工业工程、会计学、行政学、政治学与行政学、国际政治学、法学、社会学、人文科学实验班、哲学、哲学、应用化学、地质学、资源、环境与城乡规划管理、地理信息科学与技术、地理信息系统、地球物理学、光学信息科学与技术、信息安全、汉语言文学、广告学、 广播电视新闻学、艺术设计、英语、德语、日语、汉语言文学、新闻传播学、电子科学与技术、工程实验班等。
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