上海理工大学设有一十八个学院含有上海理工大学管理学院；上海理工大学出版印刷与艺术设计学院；上海理工大学医疗器械与食品学院；上海理工大学理学院；上海理工大学材料科学与工程学院；上海理工大学能源与动力工程学院；上海理工大学光电信息与计算机工程学院；上海理工大学机械工程学院；上海理工大学外语学院；上海理工大学环境与建筑学院；上海理工大学体育教学部；上海理工大学基础学院；上海理工大学沪江学院；上海理工大学社会科学学院；上海理工大学工程科技学院；上海理工大学继续教育学院；上海理工大学中英国际学院；上海理工大学中德学院等学院。
上海理工大学核心专业设置有：会展经济与管理、公共管理类（中外）、工商管理类（中外合作办学）、信息与计算科学、光信息与技术、包装工程、食品质量与安全、电气信息、数字印刷、机械、电气工程及其自动化、网络工程、轻工纺织食品、电气信息类（中外）、车辆工程、材料科学与工程、新能源科学与工程经济学、电子信息科学、系统科学与工程、应用物理学、医学影像技术、国际经济与贸易、金融学、经济学类(中外)、管理科学、公共事业管理、工业工程、会计学、市场营销、工商管理、管理科学与工程、管理科学与工程类(中外)、信息管理与信息系统、电子商务、工程管理、电子信息科学与技术、光信息科学与技术、电子信息科学类（中外）、数学与应用数学、药物制剂、机械设计制造及其自动化、测控技术与仪器、过程装备与控制工程、材料成型及控制工程、热能与动力工程、计算机科学与技术、建筑环境与设备工程、电子信息工程、自动化、交通工程、电气工程与自动化、食品科学与工程、环境工程、土木工程、机械类(中外)、能源动力、生物医学工程、医疗器械工程、印刷工程、工业设计、通信工程、光电信息工程、医学影像工程、应用化学、电子信息科学类（中外合作办学）、系统科学、英语、德语、日语、外国语言文学类(中外)、传播学、编辑出版、广告学、编辑出版学、外国语言文学、外国语言文学类（中外合作办学）、机械类（中外合作办学）、土建、智能科学与技术、新闻传播学、公共管理类（中外合作办学）、电气信息类（中外合作办学）、经济学类（中外合作办学）等几十个本科专业。
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