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杭州电子科技大学有机械工程学院等22个学院；自动化学院；会计学院；经济和商业学院；管理学院；电子信息学院；通信工程学院；计算机科学学院；人文学院；理学院；外国语学院；新闻与出版学院；软件工程学院；信息工程学院；信息与仪器工程学院；材料与环境工程学院；思想政治理论教学系；体育系；成人教育学院；国防科学技术学院；国际交流学院；卓越学院.
杭州电子科技大学的核心专业有：机械设计制造及其自动化、车辆工程、测控技术与仪器、自动化、电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术、电气工程及其自动化、软件工程、网络工程、环境工程、信息对抗技术、电子科学与技术、集成电路设计与集成系统、电子信息技术与仪器、数字媒体技术、包装工程、工业设计、光电工程、印刷工程、生物医学工程、信息工程、经济学、 国际经济与贸易、金融学、信息管理与信息系统、工商管理、市场营销、会计学、财务管理、人力资源管理、电子商务、物流管理、审计学、工商管理、工业工程、法学、教育技术学、信息与计算科学、数学与应用数学、应用物理学、电子光学科学与技术、信息安全、电子信息科学、文献传播、编辑出版学、英语、电气信息工程、医学信息工程、材料科学与工程、海洋工程与技术等本科专业。