南方医科大学研究生院成立于2016年。其前身是南方医科大学研究生院和第一军医大学研究生处。我校前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学。2004年8月整体划归广东省，更名为南方医科大学。是广东省唯一一所由教育部、国家卫生计生委和广东省共建的医科大学，也是广东省高水平大学重点建设高校中唯一一所医学院。
学校是国务院批准的第一批硕士学位授予单位，第三批博士学位授予单位；1998年被批准为首批医学硕士专业学位试点单位，2000年被批准为临床医学专业学位试点单位。2013年被认定为首批医学硕士研究生培养模式改革试点高校之一。1979年开始招收培养研究生，1987年开始招收培养博士生。经过30多年的研究生教育发展，我校建立了完整的“学士-硕士-博士-博士后”人才培养体系，拥有5个国家级重点和重点培养学科(人体解剖与组织胚胎学、内科学(消化系统疾病)、中西医结合临床、病理与病理生理学、外科学(骨外)。广东省一级重点学科9个，ESI世界排名前1%学科9个(临床医学、药理毒理、生物与生物化学、神经科学与行为、分子生物学与遗传学、化学、免疫学、材料科学与微生物学)，临床医学跻身世界前1。目前，一级学科博士学位授权学科10个，一级学科硕士学位授权学科16个；专业学位授权类别2个，硕士学位授权类别14个；目前，已为军队和地方培养约5000名博士生和1.5万名硕士生。现有研究生导师2107人，其中，学位导师258人，学位导师344人，专业学位导师172人，学位导师558人，学位导师200人，专业学位导师575人。
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