粪便样品保存多少度(科研 一种简单、方便、便宜的粪便取样方法)

科研|粪便取样方法简单、方便、便宜

以微生态为重点，以微生态为重点

独特的生物标本易于重复和快速保存，是其微生物组分析的关键。随着越来越多的人类研究将肠道微生物组纳入其设计，对简化的样品采集和储存方法有很高的需求，可以满足不同的设置和实验需求。虽然一些商业试剂盒解决了基于序列研究的收集/运输需求，但这些方法不能正确保存需要可行微生物研究的样品。本研究描述了粪便等分吸管技术，用于储存和二次取样粪便样品（FAST）。FAST允许重复的二次取样不需要解冻样品，需要最少的供应和存储空间，使实验室和现场使用非常方便。FAST通过简单、可重复的样品处理促进微生物组研究的潜力。

原名:大便样品保存多少度

FecalAliquotStrawTechnique(FAST)allowsforeasyandreproduciblesubsampling:assessinginterpersonalvariationintrimethylamine-N-oxide(TMAO)accumulation

翻译:大便样品保存多少度

粪便等分吸管技术（FAST）允许简单和可重复的二次取样：大便样品保存多少度？

评估氧化三甲胺积累的人际差异

期刊：Microbiome

IF：9.133

发布时间：2022年

通信作者：威斯康星大学毕业证书麦迪逊细菌系

实验设计图1粪便等分吸管技术（FAST）

FAST具体操作是将粪便直接排入无菌容器，然后在样品中4°C收集后48小时内将下储运送至实验室，无冻结迹象。经紫外线处理并修整过的取样铲（即修整成吸管，原文使用的耗材为VWR80081-190）反复插入粪便，直到用均匀的混合物和最小的气穴填充吸管。这个过程需要在生物安全柜里进行。如果有足够的粪便材料，每个样品处理四根吸管。如果粪便样品太软或太水，无法填充吸管，则使用无菌1ml注射器。将填充的吸管(或注射器)冷冻在干冰上，插入15ml锥形管(一根锥形管可以放两根吸管)并储存在-80℃直到后来使用(图1)。操作员在样品之间使用Trifectant更换手套净化工作空间。

图1粪便等分吸管技术2FAST冷冻粪便二次取样一致方便

将FAST从冰箱中取出处理过的样品，用无菌剃刀片切割1cm切片二次取样，将吸管保持在干冰顶部，防止解冻。从这里取两个随机选择的吸管，称为S1”和“S2”。S1仅用于DNA提取，而S2定殖无菌用于制备（GF）小鼠口服管饲法。结果共有250万个高质量序列(每个样品62，600±62,700），所有样本的Good’s覆盖率>98%。将用于α和β多样性分析的变化数据集标准化为每个样品的4500个序列。

从不同的吸管中收集FAST样品可重复性高。DNA提取前的样品处理差异很小，但通过香味多样性指数和未加权UniFrac距离评估发现受试者(即S1和S2）的多样性和总体微生物群落没有差别（图2a）。对于每个受试者来说，两个等分试样中至少有一个可以检测到几乎100%以上0.1细菌门的细菌门(图)2b）。对所有受试者，在S1可以检测到细菌门和细菌目S2检测到100%。科学水平（98.8±0.8%)，属于水平（99.1±0.6％）和OTU水平分类群（99.8±0.2％;图2b）还观察到两个等分样品之间的高度一致性。两个等分样品之间没有连续恢复OTU代表低丰度分类群（0.1-0.3%)。在所有样品中，S2中回收的OTU占S1大多数群落，在S1样品中相对丰度的总和大于98%(图2c）。

图2FAST二次取样捕获的可再生菌群3使用FAST处理的样品接种无菌小鼠

来自每个人的样品S2用作口服接种物，定殖八组不同的无菌（GF）小鼠(3只动物/组)。收集粪便样品前，饲养定殖动物2周。移植菌群的小鼠粪便样品16SrRNA基因分析表明，根据受试者的不同小鼠进行不同的聚类(图)3a）。每个受试者的四个样品中至少有一个(即S2大于三个小鼠粪粒)0.1细菌门的回收率为100%(图3b）。定植2周后，在小鼠粪便中检测到供体97.4±1.7%细菌目，91.8±2.1%细菌科和87.7±1.4%细菌属(图)3b）。虽然FAST移植捕获了大多数人类微生物群，但在口服管中饲养（S2）丰富的检测OTU小鼠没有完全恢复(图)3b，c）。2周后在小鼠中恢复OTU平均存在于口服接种物中OTU的78.5±2.2％（图3b），菌群落存在78.5±2.1％（图3d）。此外，移植小鼠的细菌群落比其供体更相似(图)3e）。

4方法应用：评估微生物胆碱代谢的个体差异

氧化三甲胺（TMAO）移植后的功能恢复可以评估微生物代谢活动的间接测量。结果表明，移植肠道菌群的胆碱代谢能力不同（图）4a），说明人际差异很大。此外，本研究表明TMAO水平与胆碱生物利用有关4b，c）。

图4TMAO与胆碱生物利用率呈负相关

本研究主要介绍了粪便等分吸管技术，提供了一个简单、廉价、可重复的工作流程，用于处理和储存可在偏远地区完成的粪便样品（人或其他动物）。它减少了运输样品的数量，并可以从有价值的样品中重复二次取样（吸管碎片）。FAST最大限度地降低法相关的风险降到最低，包括重复的冻融循环，为以后的采集工作提供了新的解决方案。

粪便等分吸管技术，操作简单方便，无需反复冻融，确实有很大的优势。但在此过程中，应保持无菌操作，避免样品融化。也许在这种方法之前，在粪便中添加保护液可能会更完美。评价只是毕业证书样本网络的个人观点。欢迎一起讨论。此外，需要粪便保护液的朋友也可以联系我们。如果您有任何问题，请一起讨论。

您也可能喜欢：找到76173814个原始粪便样本保存设计图片，包括粪便样本保存图片、材料、海报、证书背景、源文件PSD、PNG、JPG、AI、CDR等格式素材！