基因检测样品的保存条件:生物检测样品的准备、包装、保存和运输指南
1样本准备应遵循的基本原则1.1代表性原则取样的代表性与实验结果是否具有科学意义有关,因此您应根据实验目的仔细选择您的取样方案。病变组织样本不得包含正常组织,病变组织不得包含在正常组织样本中。如果条件允许,试验组和控制组的样本应在材料的时间、位置和处理条件上尽可能一致,否则可能会影响试验结果的可信度。1.2准确性原则必须准确记录代表性样本的各种特征数据,并按要求(低温、快速)采集、制备、储存和运输,最终按实验设计正确进行实验和数据处理。1.3快速原则样品质量是影响实验结果的最关键因素。因此,样品在采集、制备、储存和运输过程中应尽可能快速地缩短从样品采集到实验的时间。1.4低温原则取样离体后,应尽快放置在液氮、干冰或-80℃冰箱中,并确保实验前始终处于实验状态-70℃以下是为了避免DNA/RNA降解。2样本准备方法2.1贴壁细胞2.1.1RNA2.1.1.1壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;2.1.1.2加入适量的PBS冲洗缓冲液一次,彻底去除PBS缓冲液2.1.1.3按每10cm2(相当于六孔板一个孔或一个孔或六孔板35mm细胞加入直径培养皿)1mLTRIzol加入试剂比例TRIzol试剂;2.1.1.4使用玻璃滴管(或移液器)Tip头)反复吹细胞,直到看不到细胞块,使其完全溶解TRIzol形成清澈不粘稠的液体;2.1.1.5将TRIzol液体全部转移RNase-free的试管中2.1.1.6放入-80℃保存在冰箱里。2.1.2miRNA2.1.2.1壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;2.1.2.2加入适量的PBS冲洗缓冲液一次,彻底去除PBS缓冲液;2.1.2.3按每105-107的细胞加入600μlLysis/BindingSolution(我公司可免费提供);2.1.2.4使用移液器Tip头反复吹细胞,直到看不到细胞块,使其完全溶解在裂解液中,形成明亮不粘稠的液体;2.1.2.5将液体全部转移到RNase-free的试管中;2.1.2.6放入-80℃保存在冰箱里。2.1.3DNA2.1.3.1消化和收集胰酶1-4×106细胞(60mm培养皿或T25培养瓶),转移到1.5ml离心管中;2.1.3.23000rpm离心5min,去胰酶;2.1.3.3PBS轻轻吹一次清洗。3000rpm离心5min,去上清;2.1.3.4放入-80℃保存在冰箱里。2.1.4蛋白2.1.4.1壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;2.1.4.2加入适量的PBS冲洗缓冲液一次,彻底去除PBS缓冲液2.1.4.3按六孔板一孔或35mm加入直径培养皿细胞200µLTRIzol试剂的比例加入RIPA试剂;2.1.4.4使用玻璃滴管(或移液器)Tip头)反复吹细胞,直到看不到细胞块,使其完全溶解RIPA形成清澈不粘稠的液体;2.1.4.5将所有液体转移到离心管;2.1.4.6放入-80℃保存在冰箱里。2.2悬浮细胞2.2.1RNA2.2.1.1悬浮细胞培养诱导后,去除培养液;2.2.1.2使用保留的细胞PBS快速清洗缓冲液一次,去除离心PBS缓冲液;2.2.1.3按照每5×106个细胞加1mLTRIzol的比例加入TRIzol使用玻璃滴管(或移液器)试剂Tip头)反复吹细胞,直到看不到细胞块,使其完全溶解TRIzol形成清澈不粘稠的液体;2.2.1.4放入-80℃保存在冰箱里。2.2.2miRNA2.2.2.1悬浮细胞培养诱导后,去除培养液;2.2.2.2使用保留的细胞PBS快速清洗缓冲液一次,去除离心PBS缓冲液;2.2.2.3按照每105-107的细胞加入600μlLysis/BindingSolution(我公司可免费提供);2.2.2.4使用移液器Tip头反复吹打细胞,直至看不见成团的细胞块,使之充分溶解于裂解液形成清澈不粘稠的液体;2.2.2.5将液体全部转移到RNase-free的试管中;2.2.2.6放入-80℃保存在冰箱里。2.2.3DNA2.2.3.1收集约1-4×106细胞(60mm培养皿或T25培养瓶),转移到1.5ml离心管中;2.2.3.23000rpm离心5min;2.2.3.3PBS轻轻吹一次清洗。3000rpm离心5min,去上清;2.2.3.4放入-80℃保存在冰箱里。2.2.4蛋白2.2.4.1壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;2.2.4.2加入适量的PBS冲洗缓冲液一次,彻底去除PBS缓冲液2.2.4.3按六孔板一孔或35mm加入直径培养皿细胞200µLTRIzol加入试剂比例RIPA试剂;2.2.4.4使用玻璃滴管(或移液器)Tip头)反复吹细胞,直到看不到细胞块,使其完全溶解RIPA形成清澈不粘稠的液体;2.2.4.5将所有液体转移到离心管;2.2.4.6放入-80℃保存在冰箱里。2.3全血2.3.1RNA2.3.1.1抽提RNA建议采用BD的PAXgene管提取全血。使用淋巴细胞分离液或红细胞裂解液会使活细胞处于压力状态,从而影响细胞的基因表达;2.3.1.2PAXgene管提取全血;2.3.1.3采血以后,颠倒混匀8-10次;2.3.1.44℃过夜后转入-20℃或-80℃保存在冰箱里。2.3.2DNA2.3.2.1用EDTA抗凝管抽取1-2ml全血;2.3.2.2颠倒混合抗凝管8-10二、充分混合EDTA全血,保证抗凝效果;2.3.2.3放入-20℃保存在冰箱里。2.4血浆2.4.1采集外周血2mL,迅速转入EDTA在抗凝管中,涡旋或使用移液器Tip混匀;2.4.21小时(室温)或2小时(4℃以下操作应在条件下进行:基因检测样本保存条件
4℃,820g(9,400rpm)离心10分钟;2.4.3吸约1mL上清转清洁1.5mL离心管,16,000g(13,200rpm),4℃,离心10分钟,小心吸收新的离心管;2.4.4放入-80℃保存在冰箱里。2.5血清2.5.1采集外周血2mL,涡旋或移液器迅速转入促凝管Tip混匀;2.5.2放入冰箱4℃条件下凝固4h,4℃,3000rpm离心10分钟;2.5.3把上面清理干净1.5mL离心管,16,000g(13,200rpm),4℃,离心10分钟,小心吸收新的离心管;2.5.4放入-80℃保存在冰箱里。2.6动物组织2.6.1RNA,miRNA、DNA、蛋白质及病例检测2.6.1.1首先准备好包装样品的冷冻保存管,用油性记号笔在冷冻保存管表面多处注明样品编号;2.6.1.2动物取料时:基因检测样品的保存条件
病理样本:基因检测样本的保存条件
10%福尔马林全身灌流,冲出待检测样本中的血液;电镜样本:用生理盐水全身灌流,冲出待检测样本中的血液;RNA,miRNA、DNA、蛋白质检测样本:用生理盐水灌注全身,冲出待检测样本中的血液;准确切除所需组织后,立即切除结缔组织、脂肪组织等非研究性组织。确保组织分成小块;2.6.1.3在生理盐水或PBS快速漂洗样品,去除血渍和污垢;2.6.1.4用镊子夹住样本,放入液氮中冷却样本(病理检测的组织需置入4%多聚甲醛固定,电镜样本置于2.5%的戊二醛4℃固定);2.6.1.5根据实验目的的不同条件,放入准备好的储存管中;2.6.1.6填写样品登记表,注明样品名称、组织类型、编号、取样日期、样品处理过程等。2.7临床组织标本2.7.1RNA,miRNA、DNA、蛋白质和病理检测2.7.1.1首先准备好包装样品的冷冻保存管,用油性记号笔在冷冻保存管表面多处注明样品编号;2.7.1.2准确切除所需组织后,立即切除非研究所需的组织,并将组织分成小块;2.7.1.3用镊子夹住样品,放入液氮中冷却样品(4%以上的聚甲醛固定在病理检测组织中,电镜样品固定在2.5%的戊二醛4℃固定);2.7.1.4根据实验目的的不同条件,放入准备好的储存管中;2.7.1.5填写样品登记表,注明样品名称、组织类型、编号、取样日期、样品处理过程等。3样本包装3.1注意事项3.1.1包装样品的铝箔或冷冻储存管表面,样品编号和样品类型用油性记号笔标明。不要接触乙醇等有机溶剂。3.1.2样品不应直接用纱布、纸张和一次性手套包裹,而应用铝箔或冷冻储存管包裹,然后放入样品袋中。3.1.3液氮中不要用玻璃容器保存样品;样品包装中不要使用透明胶带。3.1.4不要将标签纸或其易碎,所以不要将标签纸或其它纸制的说明文件放入样品袋中。3.1.5样品袋绳上应贴上标签纸,不得贴在容器表面,以免脱落造成样品混乱。3.1.6不要在样品袋中放置太多样品,以防止液氮罐或从液氮罐中取出。样品袋在使用前预冷液氮。3.1.7客户在填写样本登记表时,应详细描述样本的类型、处理方法、存储条件和存储时间,以便技术人员能够确定合理的实验计划。4样本存储4.1样品冷冻储存4.1.1采集组织样品后,样品迅速放入进口优质冷冻管中,拧紧后立即放入液氮。然后转移到-80℃中保存。4.1.2组织样本储存在液氮或液氮中-80℃冰箱里。液氮保存样品,注意不要用Eppendorf管道和国产冷冻管道,由于这些管道从液氮中取出时容易爆裂,造成样品损失。4.1.3细胞样本经Trizol或RIPA处理后储存-80℃冰箱中。在-20℃冰箱不宜存放太久。4.1.4建议使用血样PAXgene管(BD)保存。4.1.5RNA样本储存于-80℃冰箱中。4.1.6病理检测样本包裹的蜡块常温保存;冷冻样本固定在4%以上的聚甲醛中24h,蔗糖梯度脱水(15%,30%),4℃保存运输,最后OCT包埋;电镜样本米粒大1cm3待检测样本2.5戊二醛固定%,4℃避光保存。5样本运输5.1干冰运输5.1.1飞机运输干冰的上限约为2kg,原则上不能运输超过2kg。火车运输不受限制。5.1.2干冰运输应采用壁厚、质量好的泡沫箱,材料应存放在编号的冷冻储存管中,用塑料袋包装后埋在干冰中。泡沫箱应扣紧,并用密封带密封。外套纸箱包装,避免开裂。并注明轻轻放置提示,以确保安全运输。5.1.3当地快递公司可以委托干冰运输,注意一定要确保48小时送达我方手中,不能送货上门的应提前通知我方。5.1.424小时到达时,干冰量不得小于5公斤;48小时到达时,干冰量不得小于8公斤。夏天可以适当增加一些干冰(通常1.5倍)。如果到达时间超过48小时,建议不要用这种方法运输。5.1.5在干冰上再放一排液体冰袋。5.1.6委托快递运输时,应随时跟踪货物情况,记录货单号,并与快递公司保持联系。5.2冰袋(GelIceorIcePack)5.2.1如果样品能在24小时内到达公司,以下样品可以用冰袋运输。5.2.2保存于RNAlater组织样本。5.2.3保存于TRIzol细胞样本或均匀浆组织样本。5.2.4用于抽提DNA新鲜抗凝全血样本。6注意事项6.1为了保证实验的顺利进行,我们强烈建议您在取样时同时备份2~3份,如备3份,则送给我们两份,如果备份2份,则送样一份,你自己留一份,以防止一些样本降解,重新取材或送样耽误你的时间。即使所有样本都合格,您也可以用备份样本进行其他实验(如定量验证、蛋白质、生化等)。6.2备份有两种,一种是严格备份,即样本取下后分为两种,这两种样本基本具有相同的性质。另一种是非严格备份,即生物重复样本,其同质性差于前者。
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