1976年，标志着商洛学院的历史起点，其前身“陕西师范大学商洛专修科”正式成立。
1984年，经过陕西省人民政府的批准，学校更名为“商洛师范专科学校”。
2005年5月，商洛农业学校整体并入“商洛师范专科学校”，教育资源进一步整合。
2006年2月，教育部正式批准学校升格为本科院校，成为一所具有地方特色、多学科协调发展的教学型本科院校。截至2006年，商洛学院已为国家培养了1.6万多名本专科人才。
2011年7月5日，陕西省教育厅与商洛市人民政府共同签署了共建商洛学院的协议，商洛学院因此成为陕西省第三所省市共建的地方本科院校。
2013年，商洛学院全日制在校生人数首次突破万人大关，达到10700人，比“十二五”规划预定目标提前两年实现万人办学规模。
历任党委书记：
张兴华：1992-1998.12担任商洛师范专科学校校长；张景书：2005.06-2008.6担任商洛师范专科学校校长；2008.6-2013.7担任商洛学院院长；刘建林：2013.6-2016.9担任商洛学院院长；范新会：2017.03起担任商洛学院校长。
截至2020年1月12日，学校官网显示，现有教职工723人，其中硕士以上学位教师518人（博士119人），高级职称教师254人。学校聘请了赵鹏大院士、张生勇院士为“双聘院士”，并拥有二级教授3人、三级教授3人，以及其他多项荣誉称号和人才计划入选者。
截至2020年1月12日，学校官网显示，现有省级“一流专业”4个（应用化学、生物技术、计算机科学与技术、汉语言文学）、省级创新创业教育改革试点学院2个（化学工程与现代材料学院、生物医药与食品工程学院）、省级大学生校外创新创业教育实践基地1个、实习实训基地173个，是陕西省“实践育人创新创业基地”。
截至2020年1月12日，学校官网显示，共获批国家自然科学基金项目9项、国家科技推广项目1项，省部级重大、攻关项目16项，获省级以上科研成果奖5项、市厅级各类科技奖励247项，取得知识产权类成果402项。教师发表的学术论文被国际权威检索机构SCI、EI、ISTP等收录308篇，出版各类著作73部，《商洛学院学报》被评为“全国高等学校优秀社科学报”“陕西省高等学校优秀社科学报”和“陕西高校精品期刊”。
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