毕节学院的发展历程：自1931年毕节县立初级中学的创建起，历经多个阶段，1938年更名为贵州省立毕节师范学校，1950年改为毕节师范学校。1958年毕节师范专科学校成立（合署），但在1961年部分专科学校被改建为毕节第三中学。同年，贵州省毕节民族师范学校并入毕节师范学校。1953年贵阳民族师范学校成立，1958年更名为贵州省毕节民族师范学校。1962年毕节师范专科学校改建为毕节中学教师进修学校，后更名为毕节师范学校。1975年毕节师范学校升格为毕节地区五七师范大学，1978年改建为贵阳师范学院（毕节大专班）。1980年毕节三中更名为贵州省毕节师范学校，1981年贵阳师范学院（毕节大专班）升格为毕节师范专科学校。1993年毕节师范专科学校更名为毕节师范高等专科学校，2005年与毕节教育学院、毕节师范学校合并，升格为毕节学院。2012年，教育部决定增加中国矿业大学（北京）对口支援毕节学院。
2014年5月23日，毕节学院更名为贵州工程应用技术学院。
历任院校领导包括：糜崇琦，1993年6月1日至2002年8月30日担任毕节师范专科学校校长、毕节师范高等专科学校校长；陈永祥，2002年8月30日至2005年10月担任毕节师范高等专科学校校长；张学立，2005年11月至2013年5月担任毕节学院院长；陶文亮，2013年5月至2016年4月18日担任贵州工程应用技术学院院长；李奇勇，2017年2月至2018年2月1日担任贵州工程应用技术学院院长；王建平，2018年8月15日至2020年2月13日担任贵州工程应用技术学院院长。
截至2020年2月13日，据学校官网显示，学校共有教职工914人，其中包括博士49人、硕士409人、正高职称57人、副高职称260人。教师队伍中有省管专家3人、市管专家10人；全国优秀教师2人、省级优秀教师4人、省级教学名师2人。此外，还有行业兼职教师、客座教授和名誉教授97人、外籍教师3人。
同时，学校设有15个学院，包括人文学院、马克思主义学院、经济与管理学院、教育科学学院、外国语学院、信息工程学院、理学院、化学工程学院、生态工程学院、矿业工程学院、土木建筑工程学院、艺术学院、机械工程学院、体育学院等，共开设46个本科专业。
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