亳州师范高等专科学校自2000年6月创立以来，不断发展壮大。
2000年10月，安徽省人民政府正式批准，将安徽省蒙城师范学校升级为亳州师范高等专科学校。
2001年，学校迎来了首届高中起点三年制大专班的学生。
到了2002年3月，经国家教育部批准，学校成功独立升格为公办普通师范高等专科学校。 [2]
2010年，亳州幼儿师范学校并入亳州师范高等专科学校，实现资源共享。
然而，2011年，亳州幼儿师范学校重新独立办学。同年9月1日起，学校整体从蒙城县迁移至亳州市谯城区。
亳州学院
2016年3月22日，教育部正式批准亳州师范高等专科学校升格为亳州学院。 [3]
2016年5月20日，亳州学院举行了盛大的揭牌仪式。 [4]
张立驰自2014年10月起担任亳州学院院长至今。
历任亳州师范高等专科学校校长包括：田世杰（1984.7-1997.12）、杨玉萍（2001.8-2002.2）、孙道德（2003.5-2004.6）、刘伟（2004.7-2009.7）、王正明（2009.8-2014.10）。
截至2019年12月29日，学校官网数据显示，学校占地面积达925亩，拥有在校生近8000人。学校设有中药学院、电子与信息工程系、生物与食品工程系、经济与管理系、教育系、中文与传媒系、外语系、美术系、音乐系、体育系、马克思主义学院等11个教学院系。 [5] 学校开设22个本科专业和34个专科专业。 [2] 2017年，亳州学院计划新增设的6个本科专业分别是生物工程（酿酒方向）、制药工程、电子信息工程、汉语言文学、经济与金融、运动康复。
学校拥有中央财政支持建设专业2个，省级特色专业8个，省级综合改革试点专业5个，省级精品课程7门，省级示范实验实训中心3个，省级校企合作实践教育基地3个，省级卓越人才教育培养计划2项，省级大学生创客实验室建设计划2项。 [2]
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