上海交通大学，源起于1896年清末洋务派政治家、实业家盛宣怀创办的南洋公学，初设师范院、外院、中院及上院四院，与北洋大学堂并称中国最早自主创办的高等学府。1959年7月31日，交通大学上海、西安两地独立，上海部分定名为上海交通大学。2001年，上海交通大学成为首批获准试办国家示范性软件学院的学府之一。
2002年，教育部批准上海交通大学成立我国高校首个海外研究生院——上海交通大学新加坡研究生院（2019年7月注册成立）。
2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，共建上海交通大学医学院，由教育部和上海市人民政府重点支持。
2006年，上海交通大学首批入选国家“111计划”。
2007年，上海交通大学成为研究生培养机制改革的首批试点高校之一。
2009年4月，上海市人民政府依托上海交通大学成立上海交通大学上海高级金融学院。
2010年6月，上海交通大学入选教育部第一批“卓越工程师教育培养计划”高校。
2012年5月，上海交通大学入选国家首批卓越法律人才教育培养计划。同年11月，又入选教育部、卫生部第一批“卓越医生教育培养计划“高校。
2014年，上海交通大学入选国家“2011计划”及国家首批卓越农林人才教育培养计划项目试点高校。
2015年10月，上海交大-南加州大学文化创意产业学院正式揭牌成立。
2016年4月8日，值上海交通大学建校120周年之际，1947届校友江泽民同志特地为母校发来贺信。
2017年9月，上海交通大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校；上海交通大学医学院成立儿科学院，我国历史最悠久的医学院儿科系正式升格为国内规模最大的儿科学院。
2018年11月，上海交通大学成为医学“双一流”建设联盟成员。
2019年4月，上海交通大学首批入选上海高等学校一流研究生教育引领计划。
以下为交通大学历任校长：
- 翁史烈：1984.7-1997.1
- 谢绳武：1997.7-2006.11
- 张杰：2006.11-2017.02.21
- 林忠钦：2017.2.21-2020.02.12
截至2020年2月12日，上海交通大学官网显示，学校师资力量雄厚，有国家“万人计划”教学名师2人，国家高层次人才特殊支持计划1人，国家级高等学校教学名师奖获得者8人，上海市教学名师奖获得者33人，国家级教学团队8个，上海市教学团队15个。开设有国家级视频公开课、精品资源共享课程、精品在线开放课程、双语示范课程等48门，上海市精品课程、重点课程、高校示范性全英语课程等343门。
同时，学校设有42个一级学科博士学位授权点，涵盖8大学科门类；57个一级学科硕士学位授权点，覆盖12个学科门类；3个博士专业学位授权点，23个硕士专业学位授权点，35个博士后流动站。此外，学校还拥有1个国家重大科技基础设施，8个国家重点（级）实验室，1个国家级科研机构，5个国家工程研究中心，2个国家工程实验室，1个国家级研发中心，3个“2011”协同创新中心，17个教育部重点实验室，1个教育部国际合作联合实验室，4个国家级国际联合研究中心，2个示范型国际合作联合基地，5个卫生部重点实验室，1个农业部重点实验室，36个上海市重点实验室，6个教育部工程研究中心。
校园占地面积300余万平方米，设有6个校区。图书馆文献累积总量（不含电子版）达338万册，电子图书总量1113.2万册，电子期刊总量5.77万种，182.05万册；生均拥有文献（不含电子文献）59.51册，生均拥有文献（含电子文献）225册。本科生均图书流通量为13册次（总量为21.02万册）。全年共采购中外文图书5.36万种，5.83万册；中外文期刊2001种；新增数据库7个，总数达到428个。各类多媒体资源总量达16.5TB。馆际互借/文献传递全年总申请量为7999条，总完成量为7206件，总满足率90.1%。
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