位于中国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市鲤鱼山路负29号的新疆医科大学厚博学院（xin jiang yi da hou bo xue yuan），是一所依托新疆医科大学综合办学优势，秉持中西医并重原则，独具地域特色的本、专科层次综合性高等医学院校。该校始建于2003年，原名为新疆医科大学厚博学院，是一所全日制普通本科独立学院。2012年，自治区人民政府批准新疆医科大学与克拉玛依市合作办学，共同建设厚博学院。2015年9月，厚博学院整体搬迁至克拉玛依市。2021年，经教育部同意，新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院，学校标识码为4165013560，同时撤销原新疆医科大学厚博学院建制。
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根据2023年12月16日学校官网信息，学校秉持“人才强校”理念，聚焦人才引进与培养，全面建设高水平教师队伍。目前，学校教职工总数为355人，附属医院兼职教师达592人。
学院已与自治区人民医院等多家附属医院签约挂牌，建立52家临床教学实习基地，其中包括30家三级甲等医院、14家国家级住培基地、8家自治区级住培基地，基本覆盖南北疆各地州，形成了“附属医院+教学医院+实习医院+教学基地”的实践教学基地体系，促进了教学、医疗、科研的良性互动。
学校设有基础医学院、公共卫生学院、药学院、临床医学院、口腔医学院、护理学院等14个二级学院，开设临床医学、口腔医学、中西医临床医学、麻醉学、护理学、药学、医学影像技术、医学检验技术、卫生检验与检疫、信息管理与信息系统以及公共事业管理11个专业。学院现有2个自治区级一流本科专业建设点，3个自治区级一流本科课程，19项自治区级教改项目。在研项目78项，近三年发表论文62篇，获得实用新型授权专利3项，自治区自然科学优秀学术论文奖3篇，1名教师获得市级骨干科技创新人才培养资格，2名教师获得市级优秀科技创新人才培养资格。
历任领导包括：冯燕俊（2012.06-2017.07.18），黄斌（2017.07-2022.08.09）担任新疆医科大学厚博学院院长；周耀治（2022.08.09-2024.05.20）担任新疆第二医学院院长。
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