学校发展历程：
1909年，晚清邮传部上海高等实业学堂（南洋公学）船政科创立，标志着中国高等航海教育的开端。
1912年，吴淞商船学校成立。
1928年，学校更名为吴淞商船专科学校。
1959年，交通部在沪成立上海海运学院。
2004年，经教育部批准，学校更名为上海海事大学，并整体搬迁至临港新城。
2009年，中国高等航海教育及上海海事大学庆祝百年华诞，百年航海教育起源于上海。
2011年，教育部批准学校与加纳中西非地区海事大学合作开展“物流管理”本科教育项目，并在非洲招生，这是上海地方高校首个在海外颁发中国高校本科文凭的项目。
2012年，学校被教育部正式认定为“接受中国政府奖学金来华留学生院校”。
2013年5月，教育部评为“2012-2013年度全国毕业生就业典型经验高校”。7月，上海海事大学与上海交通大学签订共建协议。
2014年4月，上海海事大学研究生院成立。6月，入选教育部第二批卓越工程师教育培养计划高校。
2016年12月，国际海事（中国）研究中心和联合国国际海事组织（IMO）亚洲海事技术合作中心（MTCC Asia）设立于学校；学校发起成立全球航运智库联盟和中国物流高校联盟；与上海振华重工（集团）股份有限公司、上海智能制造研究院共建“上海离岸工程研究院和海工智能制造联合研究中心”，成为首家纳入上海市功能型平台建设的市属高校。
2017年8月，认定为上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。同月，与广州南沙开发区签订战略合作协议，并在南沙区举行粤港澳大湾区供应链研究院揭牌仪式。
2018年6月，首批入选上海高等学校一流本科建设引领计划。
2019年4月，首批入选上海高等学校一流研究生教育引领计划。7月，与汕头市人民政府签订战略合作框架协议，并在汕头市委大楼举行“粤港澳大湾区供应链研究院粤东分院”和“上海海事大学湾区研究生院培训基地”揭牌仪式。
上海海事大学历任校（院）长：
陈嘉震：上海海运学院院长（1981.8-1983.12）；
陈希群：上海海运学院院长（1986.8-1991.12）；
沈康辰：上海海运学院院长（1992.1-1999.5）；
王宏彪：上海海运学院院长（1999.5-2001.10）；
於世成：上海海运学院院长（2001.10-2004.5）；
於世成：2004.5-2011.12.31任上海海事大学校长；黄有方：2011.12.31-2020.02.12任上海海事大学校长。
截至2020年2月12日，学校官网显示，学校拥有专任教师1200余人，教授160余名，博士学位教师比例约为63%。
截至2020年2月12日，学校官网显示，学校设有3个博士后科研流动站（交通运输工程、电气工程、管理科学与工程），4个一级学科博士点（交通运输工程、管理科学工程、船舶与海洋工程、电气工程），23个二级学科博士点，16个一级学科硕士点，60个二级学科硕士点，12个硕士专业学位授权类别，48个本科专业；拥有12个省部级重点研究基地；有1个国家重点（培育）学科，1个上海市高峰学科，2个上海市高原学科，9个部市级重点学科，工程学科进入ESI全球前1%；本科生16500余人，各类研究生近6000人，留学生近700名；专任教师1200余名。
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