冯捷：1980年2月至1983年6月，担任哈尔滨船舶工程学院院长；邓三瑞：1983年6月至1987年6月，担任哈尔滨船舶工程学院院长；吴德铭：1988年10月至1994年5月，担任哈尔滨船舶工程学院院长；1994年5月至1997年12月，担任哈尔滨工程大学校长；邱长华：1997年12月至2004年6月，担任哈尔滨工程大学校长；刘志刚：2004年6月至2015年4月；姚郁：自2015年4月至今，担任哈尔滨工程大学校长。
哈尔滨船舶工程学院现已更名为哈尔滨工程大学。哈尔滨工程大学位于风光秀丽的松花江畔，北国冰城哈尔滨市，隶属于工业和信息化部，是我国首批入选国家“211工程”建设和设有研究生院的全国重点大学。学校是我国“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）领域关键的人才培养和科学研究基地。其前身是成立于1953年的中国人民解放军军事工程学院（“哈军工”）。1970年，在哈军工原址，以海军工程系全建制及其它各系（部）部分干部教师为基础，组建了哈尔滨船舶工程学院。1978年，学校被国务院确定为全国重点大学；1982年，成为首批具有博士、硕士学位授予权的单位；1994年，更名为哈尔滨工程大学；1996年，成为首批“211工程”建设高校；2002年，由教育部批准设立研究生院；2007年，由国防科工委、教育部、黑龙江省政府、海军四方共建。学校现隶属于工业和信息化部。
截至2020年1月20日，学校官网显示，学校设有研究生院，拥有博士后科研流动站9个，博士后科研工作站1个，一级博士学位授权学科6个，二级博士学位授权学科25个，硕士学位授权学科93个（含MBA），工程硕士授权工程领域18个，高校教师在职攻读硕士学位招生专业15个，本科专业50个，是我国首批有权授予博士、硕士学位的单位。学校现有国家级重点学科3个，国防重点学科7个，省部级重点学科24个，国家级重点实验室2个，国家级电工电子教学基地1个，省部级重点实验室6个，各类专业和基础实验室共计47个。截至2020年1月20日，学校官网显示，学校现有教职工2600多人，其中中国工程院院士5人，博士生导师192人，教授、副教授近900人，国家及省部级有突出贡献的中青年专家36人。学校现有各类在校学生25000多人，其中研究生6500多人。
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