1946年，中国共产党为纪念著名教育家陶行知先生，创建了行知师范学校（即哈尔滨师范大学的前身），最初校址设立在南岗区果戈里大街。1949年，学校整体迁移至建国街2号。
1951年，学校分立为松江省属的松江师专和哈尔滨市属的哈尔滨师专。1952年，两校再次合并，成立松江师专。
1953年，学校更名为哈尔滨师范专科学校，归属教育部管理。
1956年，学校更名为哈尔滨师范学院，并迁址至和兴路50号。
1960年，哈尔滨艺术学院并入哈尔滨师范学院，成立艺术系。
1980年，学校正式更名为哈尔滨师范大学。
2001年，学校主体迁移至哈尔滨利民经济开发区师大路一号。
2002年，黑龙江省物资职工大学和黑龙江省物资学校并入哈尔滨师范大学。
2005年9月，学校以“优秀”成绩通过了国家教育部本科教学水平评估。
2010年，学校撤销阿城校区（阿城学院），并入江南校区；同年，艺术三大系整合至江南校区，分别成立音乐学院、美术学院、传媒学院。
2014年，呼兰校区（基础教育学院）迁回主校区，即哈尔滨师范大学松北校区。
2017年11月，学校荣获第一届全国文明校园荣誉称号。
2018年2月，学校被选为黑龙江省高水平大学和优势特色学科建设高校及建设学科。
2019年1月，学校入选教育部“三全育人”综合改革试点高校。
2019年8月，学校马克思主义学院被评为第三批全国重点马克思主义学院。
以下是历任校长简介：李松涛：1980.2-1983.6任哈尔滨师范大学校长；徐国林：1983.6-1997.3任哈尔滨师范大学校长；王佐书：1997.3-1999.12任哈尔滨师范大学校长；陈述涛：1999. 7-2008. 1任哈尔滨师范大学校长；王选章：2008. 1至今任哈尔滨师范大学校长。
截至2020年1月20日，根据学校官网信息，学校设有25个学院（部），开设83个本科专业，拥有一批省级重点一级学科（群）和省级领军人才梯队。学校具备完整的学士、硕士、博士学位授予体系，拥有9个博士学位授权一级学科，22个硕士学位授权一级学科，8个专业硕士学位授权类别，6个博士后科研流动站，并是全国教育硕士专业学位研究生联合培养示范基地。材料科学学科进入ESI全球排名前1%。马克思主义理论、教育学、美术学和中国语言文学4个一级学科进入全国前30%。
截至2020年1月20日，学校官网显示，学校拥有一支高水平的教师队伍。现有专任教师1700余人，其中包括国家“万人计划”哲学社会科学领军人才1人，国家“万人计划”教学名师1人，全国文化名家暨“四个一批”人才1人，“百千万人才工程”国家级人选4人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者3人，享受国务院政府特殊津贴16人，首批“全国高校黄大年式教师团队”1个；“龙江学者”10人，省杰出青年基金项目获得者8人，享受省政府特殊津贴19人，省优秀中青年专家13人，省文化名家暨“六个一批”人才24人，省级教学名师14人，省级领军人才梯队带头人17人。
截至2020年1月20日，学校官网显示，学校已为社会培养了40余万名优秀人才，其中包括众多世界和全国知名的优秀人物，如“全国优秀教师”宋立志、“全国道德模范”张丽莉、“全国劳动模范”王惠生、“感动中国人物”秦艳友、“世界小姐总冠军”于文霞、“中国象棋世界冠军”王琳娜、“世界速滑锦标赛冠军”王北星、“世界大学生冬季运动会速滑冠军”付春艳。这些校友中，许多人已成为黑龙江省乃至全国的骨干教师和社会精英，为国家和我省的经济社会发展提供了重要的人才支持，为学校赢得了广泛的社会赞誉。
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