在延边医学院的历史长河中，众多领导人物曾担任要职。沈铁宽教授于1988年12月至1994年12月担任院长；孙东植教授在1994年12月至1996年6月期间执掌学院；金柄珉教授于2003年1月至2012年6月担任延边大学校长；朴永浩教授自2012年6月至2017年1月担任校长；现任校长金雄教授自2017年1月至今领导学校。
追溯延边大学医学院的起源，可至1948年10月1日创立的延边医科专门学校。随着1949年4月延边大学的成立，该校并入成为医学部。1958年8月，延边医学院独立出来，成为一所单独的高等学府。1996年，延边医学院与区域内其他四所高校合并，成为延边大学医学院的一部分。2005年4月，延边大学医学部成立，涵盖了基础医学院、临床医学院、中医学院、药学院和护理学院。2012年3月，为适应医学教育国际化的趋势，基础医学院扩展成立了新的延边大学医学院。
根据2020年1月10日的学校官网信息，延边大学医学院设有临床医学、预防医学、口腔医学、麻醉学、药学、药物制剂、制药工程、中医学、护理学等9个全日制本科专业，以及1个护理学专科专业。其中，临床医学和药学专业为国家特色专业，护理学专业则被认定为吉林省特色专业。学院致力于培养本科生、硕士生、博士生三个层次的医学人才，并设有神经生物学研究所、生物免疫研究所、肿瘤研究中心、健康研究所、运动医学研究所、护理学研究所、民族医药研究所等7个研究机构及13个研究室。
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