1946年7月，为满足建立东北根据地急需大量专业干部的需求，东北银行总行在佳木斯举办了第一期短训班。本期短训班共招收并培训了120名银行干部，并于1946年10月7日顺利结业。1948年3月，东北银行总行从佳木斯迁移至哈尔滨，将短训班设立在哈尔滨市田地街。章梦生同志负责短训班工作，陆续举办了第二、三期短训班，每期为期3个月，累计招收和培训银行干部90名。1948年9月，总行训练班组建了一支以银行业务负责人为主的兼职教师队伍，有计划地完成了干部培训任务，扩大了社会影响力，开创了东北金融教育的新局面。1948年12月，总行训练班随东北银行总行迁至沈阳市，训练班位于沈阳市小南门里原交通银行旧址。至1950年2月，东北银行总行训练班共举办了七期短训班，累计培训银行干部1207名。东北银行总行训练班的建立及其持续完善，为学校教育的实施奠定了基础。
1958年7月，在中共吉林省委财贸部的领导下，成立了学院筹备委员会。9月29日，吉林省人民委员会第二次会议决定：正式成立吉林财贸学院，同时中国人民银行长春银行学校停办。1964年4月，根据上级要求，专业调整为会计、统计、财政金融、贸易经济四个专业，确立了学院的发展方向。1966年5月11日，学院党委召开会议，学习中共吉林省委宣传部《关于文化大革命的紧急通知》。会后，召开全院大会，传达省委文件精神，动员师生参与文化大革命。此时，财院与兄弟院校一样，面临着一场全国性的政治运动即将来临。
1992年5月，经国家教委批准，吉林财贸学院划归国家税务总局领导，更名为长春税务学院，成为全国第一所税务本科普通高等学校，肩负起为全国税务系统和吉林省培养高级税务及各类财经管理专门人才的重任。2000年，在高等院校布局结构调整中，学院又划归吉林省，成为省属院校。2004年初，长春税务学院被确定为吉林省重点高校。2010年，教育部批准长春税务学院更名为吉林财经大学。
现任领导：
- 朱涛：1980-1983年，任吉林财贸学院院长；
- 关东生：1983-1986年，任吉林财贸学院院长；
- 徐世友：1986-1992年，任吉林财贸学院院长；
- 徐世友：1992-1994年，任长春税务学院院长；
- 李德忠：1996-2003年，任长春税务学院院长；
- 宋冬林：2004.6-2010.6年，任长春税务学院院长；
- 宋冬林：2010.6-2018.10年，任吉林财经大学校长；
- 孙杰光：2018.11年至今，任吉林财经大学校长。
截至2020年1月10日，学校官网显示，学校已形成以经济学科、管理学科为主体，法学、文学、理学、工学等学科协调发展的学科特色。现有经济学、管理学、法学、文学、理学、工学六大学科门类；拥有吉林省“十三五”优势特色高水平学科8个，其中“一流学科A类”1个，“一流学科B类”1个，“优势特色学科A类”1个，“优势特色学科B类”5个；设有理论经济学、应用经济学、法学、马克思主义理论、外国语言文学、数学、统计学、管理科学与工程、工商管理、公共管理等10个硕士学位授权一级学科；设有工商管理、法律、税务、应用统计、国际商务、会计、审计、金融、公共管理、保险、新闻与传播、图书情报等12个硕士专业学位类别。
截至2020年1月10日，学校官网显示，学校现有教职员工914人，其中专任教师578人。专任教师队伍中包括教育部“跨世纪优秀人才培养计划”“新世纪优秀人才支撑计划”入选者，国家哲学社会科学研究“九五”“十五”“十一五”“十二五”规划应用经济学学科规划小组（学科评议组）成员，国家自然科学基金评审专家，教育部高等学校财政学、经济学、工商管理类学科专业教学指导委员会成员，国务院政府特殊津贴获得者，全国优秀教师等。
截至2020年1月10日，学校官网显示，学校现有34个本科专业，其中包括国家级专业综合改革试点单位1个；国家级特色专业6个，省级特色专业10个，吉林省高校品牌专业7个；国家级精品课程1门，省级精品课程32门；国家级优秀教学团队1个，省级优秀教学团队14个；省级实验教学示范中心7个；省级人才培养模式创新实验区4个。
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