广西中医药大学，源于1956年创立的广西中医学校，1964年晋升为本科院校，1971年与南宁高等医学专科学校合并，形成了现今的规模。该校于2012年1月13日经国家委员会投票通过，正式更名为广西中医药大学，成为一所以医药学科为核心，涵盖医学、工学、管理学等多个学科门类的高等学府，集教学、科研、医疗和药品生产于一体，同时也是中西部高校基础能力建设工程的重要成员。该校在壮医药教育领域具有独特的办学特色。
自1979年起，广西中医学院开展研究生教育，并于1986年获得硕士学位授予权。
自1996年起，学校与上海中医药大学等7所高校合作，联合培养博士研究生。
2003年，在教育部高校本科教学工作水平评估中，广西中医学院荣获“优秀”等级，成为广西首个获此殊荣的高校。
2009年，学校与广州中医药大学合作，设立博士后科研流动工作站，共同培养博士后。
2012年3月，经国家教育部批准，更名为广西中医药大学，同年，学校入选中西部高校基础能力建设工程。
2013年9月，学校搬迁至仙葫校区。
2015年3月，经教育部批准，学校与美国督优维尔学院联合举办护理学本科教育；同年12月1日，广西壮族自治区人民政府与国家中医药管理局签署协议，共建广西中医药大学。
2016年2月28日，广西壮族自治区成立60周年重大民生工程项目——广西国际壮医医院（广西中医药大学附属国际壮医医院）建设项目启动。
2018年5月，学校获批增列为博士学位授予单位，中医学、中医博士获得新增博士学位授权点；同时入选广西一流学科建设高校。
2019年11月，《国家级非物质文化遗产代表性项目保护单位名单》公布，广西中医药大学荣获“壮医药（壮医药线点灸疗法）”项目保护单位资格。
历届领导包括：韦贵康（1989.6-1998.5任广西中医学院院长）；王乃平（1998.5-2009.7任广西中医学院院长）；朱华（2009.7-2010.5任广西中医学院院长）；唐农（2010.5-2012.03任广西中医学院院长；2012.03-2020.02.01任广西中医药大学校长）。
截至2020年2月1日，学校官网显示，拥有专任教师1025人，外聘教师82人。专任教师中，正高职称260人，博士学位385人，博士生导师25人，硕士生导师693人。学校还汇聚了国医大师1人、全国名中医2人等众多优秀人才。
截至2020年2月1日，学校官网显示，学校设有博士学位授权一级学科1个、硕士学位授权一级学科6个，博士专业学位类别1个、硕士专业学位类别3个，二级学科硕士学位授权学科43个，是硕士研究生推免资格高校。学校拥有国家临床重点专科10个，国家中医药管理局中医药重点学科14个，重点培育学科4个，重点专科9个。自2015年以来，学校顺利通过教育部本科教学工作审核评估和中医学、临床医学、护理学、中药学专业认证，中医学专业认证获得教育部专家组的“完全认可”，临床医学专业认证有效期为6年。
近三年来，学校承担国家级科研项目126项，省部级项目178项，厅局级项目633项。获得科技奖励63项，其中省部级以上奖励30项。出版科技专著62部，发表科技论文3524篇，SCI收录论文137篇；获国家专利授权60项，软件著作权登记2项。
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