广东药科大学的历史可追溯至1902年伍汉持创立的图强医学堂（图强助产学校）。1958年，广东省卫生干部进修学院成立；1978年，学校升格为普通本科高校，定名为广东医药学院。1994年，更名为广东药学院。2016年，经教育部批准，学校正式更名为广东药科大学。
以下是学校的发展历程：
- 1958年：广东省卫生干部进修学院
- 1978年：广东医药学院
- 1994年：广东药学院
- 2004年：广东药学院中山校区建立
2003年，广东药学院成为硕士学位授予单位。2004年，广州铁路局广州铁路中心医院转制为广东药学院直属附属医院，更名为“广东药学院附属第一医院”。
2006年，广东药学院入选国家大学生文化素质教育基地。2007年，学校以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估。
2014年，广东药学院通过全国首批药学专业认证。2016年3月，经国家教育部批准，更名为“广东药科大学”；12月，获得广东“省市共建本科高校”不少于5亿元的专项经费及省财政配套资金支持。
2017年6月，广东药科大学新增为广东省博士学位授予立项建设单位；9月，广东药科大学（云浮校区）正式动工建设；12月，由广东药科大学发起成立的“中国整合药学联盟”成立。
历任校长如下：
- 朱家勇：2002.2-2014.04，任广东药学院院长
- 郭姣：2014.04-2016.07.17，任广东药学院院长
- 郭姣：2016.07.17-2020.1.31，任广东药科大学校长
- 梁仁：1994.3-2002.2，任广东药学院院长
- 梁仁：1990.6-1994.3，任广东医药学院院长
- 陈英扬：1983.12-1990.6，任广东医药学院院长
- 张同久：1979.4-1983.12，任广东医药学院院长
截至2020年1月31日，广东药科大学官网显示，学校有教职工1598人，其中专任教师1332人。教师队伍中，具有硕士、博士学位人员占76.8%，具有高级专业技术职务人员占52.7%。学校还拥有博、硕士生导师297人，特聘教授5人（其中院士3人），南粤百杰培养工程人才1人，珠江学者4人，国务院特殊津贴专家19人，教育部新世纪优秀人才2人，国家级、省级“千百十工程”培养对象20人，教育部教学指导委员会委员3人，全国优秀科技工作者1人，中华中医药学会科技之星1人，全国模范教师1人，全国及南粤优秀教师20人，广东省特支计划2人，广东省教学名师3人，省级高层次研究团队5个等。
学校官网还显示，广东药科大学设有药学院、中药学院、中药资源学院、中医学院、临床医学院、公共卫生学院、基础学院、医药商学院、医药经济学院、医药信息工程学院、生命科学与生物制药学院、护理学院、食品科学学院、医药化工学院、健康学院、外国语学院、继续教育学院、国际教育学院、人文社会科学部、体育部等18个院（部），开设45个本科专业。学校被住房与城乡建设部选定为职业技能鉴定试点单位（广东省唯一试点单位）。
广东药科大学还拥有国家中医药管理局重点学科2个，广东省优势重点学科3个，广东省攀峰重点学科1个，校级重点学科12个，博士后科研工作站1个；有5个硕士学位授权一级学科，6个硕士专业学位授权类别。
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