北京交通大学，起源于19世纪末期清政府邮传部设立的铁路管理传习所。到了1921年，该校与上海、唐山两所工业专门学校合并，正式定名为“交通大学”，并在京、沪、唐三地设立分校，其中北京分校被称为“交通大学北京学校”。1949年7月，经中国人民革命军事委员会铁道部命令，国立交通大学北平学校更名为“中国交通大学”，并由毛泽东主席任命桥梁专家茅以升担任校长。1950年，中央人民政府政务院决定将中国交通大学更名为“北方交通大学”。
1981年，北方交通大学成为全国首批博士、硕士学位授予单位，并获得了自行审定副教授、教授及博士生导师任职资格的权限。1994年7月，北方交通大学通过铁道部预审，成为首批进入“211工程”建设的高校之一。2000年4月，原北京电力高等专科学校并入，学校的管理由铁道部划归教育部。2003年9月，学校正式更名为“北京交通大学”。2013年4月，北京交通大学牵头的“轨道交通安全协同创新中心”被教育部认定为国家首批14个协同创新中心之一。2016年5月，学校入选科技部“创新人才培养示范基地”。
2017年9月，北京交通大学入选国家“双一流”世界一流学科建设高校名单。同年，学校加入国际铁路合作组织（OSJD）和中国-中东欧高校联合会。
2018年1月，学校被教育部认定为首批国家级新工科研究与实践项目。2019年7月，教育部与交通运输部联合发布关于共建北京交通大学的意见，标志着学校获得交通运输部共建支持。同年9月，学校成为中国人工智能教育联席会的创始成员和理事单位。
**历任领导：**
- 北京铁道学院：
- 王孝慈（院长兼院党委书记）：1953年7月-1958年12月
- 北方交通大学：
- 王见新（党委书记、校长）：1978年-1983年
- 张树京：1983.6-1988.4
- 万明坤：1988.6-1994.12
- 王金华：1994.12-1998.12
- 谈振辉：1998.12至2008.3任北方交通大学校长
- 宁滨：2008.3-2019.5
- 王稼琼：2019.5至现今任北京交通大学校长
截至2020年1月6日，学校拥有省部级及以上科研平台59个，其中包括中国国家重点实验室1个、中国国家“2011计划”协同创新中心1个、中国国家工程研究中心1个、中国国家工程实验室6个（其中1个主持）、中国国家能源研发中心1个、中国国家国际科技合作基地1个、中国国家认可实验室4个、中国国家大学科技园1个、中国教育部重点实验室/工程研究中心9个、北京实验室2个、北京市重点实验室/工程技术研究中心17个、首批首都高端智库1个、北京市哲学社会科学研究基地4个、交通运输行业重点实验室2个，以及其他省部级科研平台8个。
截至2020年1月6日，学校设有电子信息工程学院、计算机与信息技术学院、经济管理学院、交通运输学院、土木建筑工程学院、机械与电子控制工程学院、电气工程学院、理学院、语言与传播学院、软件学院、马克思主义学院、建筑与艺术学院、法学院、国家保密学院等14个学院，并设有研究生院以及远程与继续教育学院，共开设59个本科专业。
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