西北农林科技大学的历史可追溯至1934年创建的国立西北农林专科学校，这是学校发展的起点。
在1934年，西北林学院成立，起源于原西北农学院森林系，并于1979年独立为西北林学院，由林业部和陕西省共同管理，以林业部为主导。
1938年7月，根据教育部的命令，与国立西北联合大学农学院、河南大学农学院畜牧系合并，成立了国立西北农学院。解放后，国立西北农学院更名为西北农学院。
1985年，经原农牧渔业部批准，学校更名为西北农业大学。
1999年9月11日，原西北农业大学、西北林学院、中国科学院水利部水土保持研究所、水利部西北水利科学研究所、陕西省农业科学院、陕西省林业科学院、陕西省中国科学院西北植物研究所等七家教学科研单位合并，共同组成了西北农林科技大学。
2003年8月，教育部批准学校设立研究生院。
2004年6月，学校被纳入国家"985工程"建设行列。
2007年6月，教育部正式批准学校成立研究生院，孙其信教授担任研究生院院长。同年9月，学校成为国家大学生创新性实验计划的首批入选高校。
2009年，西北农林科技大学成为教育部和农业部的共建高校。
2010年，学校成为教育部和国家林业局的共建高校。
2012年9月，学校首批入选国家级大学生创新创业训练计划实施高校。
2017年9月，西北农林科技大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校。
历任领导包括：刘于鹤（1983.12-1986.7任西北林学院院长）、王性炎（1986.7-1991.12任西北林学院院长）、李广毅（1991.12-1997.11任西北林学院院长）、陈存根（1997.11-1999.9任西北林学院院长）、张岳（1985.10-1991.11任西北农业大学校长）、荆家海（1991.11-1996.1任西北农业大学校长）、张宝文（1996.1-1999.1任西北农业大学校长）、陈宗兴（1999.9-2003.8任西北农林科技大学校长）、孙武学（2003.8-2011.1任西北农林科技大学校长）、孙其信（2011.1-2017.7.19任西北农林科技大学校长）、吴普特（2017.12.27-2020.1.27任西北农林科技大学校长）。
截至2020年1月27日，学校官网显示，教职工总数为4535人，其中包括2236名专任教师，619名正高级专业技术人员，以及1310名副高级专业技术人员。学校拥有1名中国科学院院士，2名中国工程院院士，11名双聘院士；7名国家“人才项目专家”入选者，13名青年人才项目专家入选者；6名“长江学者”特聘教授，3名青年长江学者；6名“万人计划”科技创新领军人才，3名青年拔尖人才；8名国家杰出青年科学基金获得者，8名优秀青年基金获得者；12名国家百千万人才工程入选者，64名新世纪优秀人才支持计划入选者；43名陕西省“百人计划”入选者，12名学校“特聘教授”，以及2名国家教学名师。
截至2020年1月27日，学校官网显示，学校设有26个学院（系、所、部）和研究生院，设有13个博士后流动站，16个博士学位授权一级学科，27个硕士学位授权一级学科，67个本科专业。学校有7个国家重点学科和2个国家重点（培育）学科；农业科学在全球US.NEWS学科排名中位居第30位；农业科学学科领域进入ESI全球学科排名前1‰；农业科学、植物学与动物学、工程学、环境科学与生态学、化学、生物学与生物化学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学等8个学科进入ESI前1%。学校还建立了2个国家重点实验室，1个国家工程实验室，3个国家工程技术研究中心，3个国家野外科学观测研究站，以及66个省部重点实验室及工程技术研究中心。
截至2020年1月27日，学校自合并以来，共获得42项国家级科技奖励，其中14项为学校主持完成；主持完成的省部级科技成果一等奖79项；获得陕西省科技进步最高成就奖1项。学校共获得1421件国家授权发明专利，审定动植物新品种547个。发表SCI、EI、SSCI论文21627篇，其中2018年以第一署名单位发表SCI、EI、SSCI论文2814篇。学校现有8家农、林、水专业陕西省一级学会挂靠，编辑出版20种学术期刊，并建立了大学出版社。
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