朱钟元，2004年6月28日至2009年5月；李麟书，自2009年5月起担任安徽国防科技职业学院院长至今。
学院的历史可追溯至1974年，当时安徽省大江机械工业学校成立。
1982年，安徽省广播电视大学（省国防工办分校）与安徽省国防工业干部学校并入安徽省大江机械工业学校。
1997年，安徽省大江机械工业学校更名为安徽国防科技工业学校。
2003年6月，经安徽省人民政府批准、教育部备案，学校独立升格为公办全日制普通高等职业院校。
2015年7月，学校加入大别山革命老区高校联盟。
安徽国防科技职业学院（原名为省大江机械工业学校）始建于1974年，1982年从舒城晓天镇迁至六安市，与省广播电视大学国防工办分校及省国防科技工业干部学校合并办学。1997年，经省人民政府批准更名为安徽省国防科技工业学校（省部级重点中专学校），2003年6月经安徽省人民政府批准，升格为安徽国防科技职业学院，隶属于安徽省国防科学技术工业办公室。
据2019年12月29日学校官网信息显示，学院设有6个教学系、37个专科专业。学院拥有专兼职教师300余人，其中包括正教授6人、副教授近70人、双师素质教师201人、省级优秀教师2人、省级专业带头人8人、省级教坛新秀4人、省级教学团队5个。学院建立了93个校内实训室，配备了塑胶跑道标准田径运动场、篮球场、排球场、网球场以及近3000平方米的室内体育馆。学校已与安徽集团、奇瑞汽车有限公司、科大讯飞股份有限公司、长虹模塑有限公司、武汉汇众聚成科技有限公司、中航国铁教育集团等近20家省内外高端企业建立合作关系。学院教师获得省级科研立项50余项，公开发表论文600多篇。图书馆纸质中文藏书总量为46万余册，其中专业图书占50%左右，综合杂志300余种，电子图书37.8万册，电子期刊近7000种。学院设有四系两部，包括机械工程系、机电工程系、管理工程系、信息工程系以及基础教学部、思政教学部，两个中心：实验实训中心和计算机中心，并下辖安徽省工业工程设计院（安徽省医药工程设计院）。学院开设了机械设计与制造、机械制造与自动化、数控技术、模具设计与制造、机电一体化技术、市场营销、电子商务、物流管理等29个专业，其中数控技术（导弹炮弹加工技术方向）、机电一体化技术（引信技术方向）等4个专业为军工特有专业。目前，在校高职生人数超过6600人。
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