巴音郭楞职业技术学院，成立于2002年2月19日，是新疆维吾尔自治区人民政府批准设立的一所全日制、综合性高等职业技术学院。该学院由原巴州财贸学校、巴州农校、巴州技工学校、库尔勒市职业中专、库尔勒市第十中学五所学校合并组建。2002年2月8日，自治区教育厅党组通过并上报自治区人民政府批准设立巴音郭楞职业技术学院。同年2月19日，自治区人民政府正式批准成立巴音郭楞职业技术学院，标志着“华夏第一州”拥有了属于自己的大学。
2002年2月26日，新疆维吾尔自治区教育厅副厅长薛健同志与巴音郭楞蒙古自治州党委书记张志恒同志共同为巴音学院揭牌，学院正式宣告成立。
2002年4月22日，时任自治区人民政府主席的阿不来提·阿不都热西提亲临巴州，在州委书记张志恒、州长巴代的陪同下，为学院新校区“巴音苑”破土动工剪彩。
2017年8月，学院被选为教育部第二批现代学徒制试点单位。
2019年10月，学院顺利通过教育部现代学徒制第二批试点单位验收。
以下是历任院长名单：白永红，2002年至2013年6月17日任巴音郭楞职业技术学院院长；马怀立，2013年6月17日至2017年9月7日任院长；王贵忠，2018年3月12日至2020年2月18日任院长。
截至2020年2月18日，学校官网显示，学院现有专任教师225人，涵盖汉、蒙、维、回等七个民族，其中本科学历者201人，高级专业技术职务者114人，“双师型”教师43人。
截至2020年2月18日，学校官网显示，学院紧密围绕巴州石油石化、矿产、农副产品加工、棉花系列加工等五大支柱产业，设有电子信息工程学院、机械电气工程学院、石油化工学院、人文经济学院、传媒学院、矿业工程学院、继续教育学院、体育学院、生物工程系、纺织工程系、交通工程系、旅游系、基础课教学部等8院4系1部。学院开设了53个中职专业和30个高职专业，其中畜牧兽医是自治区重点扶持的特色专业，思想道德修养与法律基础是自治区级重点建设课程。
学院致力于提升办学效益，扩大高职教育规模，积极与国内外高校及知名企业开展联合办学。已与丹麦巴瑞专科学校、加拿大阿伯兹福特学院、俄罗斯卡尔梅克共和国、日本京都民际日本语学校等多家国外高校实现联合办学，双方教师交流达10人次，5名学生赴丹麦留学。同时，学院与清华大学、新疆大学等20余所国内高等院校建立了合作关系。
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