在西安医学教育的历史长河中，多位杰出校长曾执掌教鞭。王光清教授于1980年10月至1986年5月担任西安医学院院长；任惠民教授则在1986年5月至1998年12月期间担任西安医科大学校长；朱宏亮教授于1998年12月至2000年4月担任西安医科大学校长。
自1912年10月26日国立北京医学专门学校创立以来，这所中国政府设立的首个国立西医学校，便肩负着培养医学人才的重任。
到了1928年11月，学校更名为国立北平大学医学院，以研究高深医学学术、培育医学专才为宗旨。
1937年抗日战争爆发，为反抗侵略并延续学脉，师生们千里跋涉，西迁至陕西。他们历经重重困难，穿越封锁线，历时3个月余抵达西安，建立了国立西安临时大学医学院。在战火纷飞的年代，坚持办学，砥砺前行，为西北高等医学教育翻开新篇章。抗战胜利后，学校在大西北扎根，数度更名，1950年称为西北医学院，1956年更名为西安医学院，1985年正式更名为西安医科大学，成为原卫生部直属的11所重点大学之一。
1981年11月，学校荣获国务院批准，成为全国首批博士和硕士学位授予单位。
1985年，经教育部批准，西安医学院正式更名为西安医科大学。
2000年4月，国务院将原西安医科大学、原陕西财经学院与原西安交通大学合并，组建新的西安交通大学；西安医科大学更名为西安交通大学医学院。
2012年6月，响应教育部医学教育改革精神，西安交通大学医学院升级为西安交通大学医学部。
西安医科大学，作为卫生部在西北地区唯一的直属院校，坐落于十三朝古都西安。校园占地900余亩，建筑面积达54万平方米。学校以医科为主，文理兼容，形成了相互促进、相互渗透的多层次综合性医科大学。目前，学校涵盖研究生、本科、专科、中专及成人教育五个层次。设有第一、二临床医学院、口腔医学院（含三所附属医院）、基础医学院、成人教育学院、药学院、法医学院、公共卫生学院、社区医学院、陕西临床医学院（陕西省医院）等十个学院和一个社会科学部，以及一所附设卫生学校。学校开设临床医学、口腔医学、预防医学、药学、法医学、护理学、妇幼卫生、外语、卫生事业管理、生物医学工程、社区医学、儿科学、医学检验等11个专业。现有39个学科点具有硕士学位授予权，10个学科点具有博士学位授予权；设有1个博士后流动站，13个研究所，4个研究中心，30个研究室和3个省级重点实验室。学校图书馆藏书近72万册，设施先进，已与国际信息网络（Internet）联网，为师生提供丰富的学术资源。
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