自1956年起，原中央人民政府交通部济南汽车机械学校成立，归交通部直属。
到了1958年，学校升级为山东交通专科学校，并于1960年与山东航运学校合并，此时隶属于山东省交通厅。
1962年，济南交通学校成立，先后在1964年归交通部管理，1969年划归山东省交通邮政局。
1970年，地方国营济南卫东机械厂成立，由济南市人民政府管理。
1973年，山东省交通学校成立，并在同年与山东交通技工学校合并，由山东省交通厅主管。
1980年，交通部济南交通学校成立，1984年与济南交通职业专科学校合并，继续由交通部领导。
1988年，济南交通高等专科学校成立，仍隶属于交通部。
2002年，山东交通学院正式成立，2005年与山东水运学校合并，由山东省人民政府领导，教育厅与交通厅共同管理。
2007年，交通部与山东省政府签署共建协议，山东交通学院成为交通运输部共建的八所高校之一。
山东交通学院下设汽车工程学院、交通与物流工程学院、工程机械学院、交通土建工程学院、信息科学与电气工程学院、财经学院、管理学院、艺术与设计学院、外国语学院、理学院、海运学院、材料科学与工程学院、航空学院、船舶与海洋工程学院、游艇邮轮工程学院、轨道交通学院、国际教育学院、交通法学系等18个二级学院，以及社会科学教学部、体育教学部、继续教育学院、职业技术学院等4个教学单位。
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